More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1159 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
209 aa  418  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0981  orotate phosphoribosyltransferase  77.4 
 
 
209 aa  337  5.9999999999999996e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  66.03 
 
 
209 aa  301  7.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  60.49 
 
 
207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  57.07 
 
 
210 aa  246  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  57.71 
 
 
207 aa  241  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  51.69 
 
 
213 aa  234  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  54.11 
 
 
210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  51.94 
 
 
212 aa  231  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  54.11 
 
 
210 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1289  orotate phosphoribosyltransferase  55.72 
 
 
203 aa  230  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  54.11 
 
 
210 aa  230  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
209 aa  230  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1264  orotate phosphoribosyltransferase  55.72 
 
 
203 aa  230  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  54.11 
 
 
210 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  54.11 
 
 
210 aa  229  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  54.11 
 
 
210 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  54.11 
 
 
210 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
211 aa  229  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  53.62 
 
 
210 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  53.62 
 
 
210 aa  228  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  53.62 
 
 
210 aa  228  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  54.11 
 
 
210 aa  228  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0771  orotate phosphoribosyltransferase  54.23 
 
 
203 aa  227  8e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 
221 aa  224  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_002950  PG1353  orotate phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1094  orotate phosphoribosyltransferase  48.76 
 
 
212 aa  214  5e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2181  orotate phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 
217 aa  205  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.134132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
215 aa  203  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  50 
 
 
213 aa  202  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.06 
 
 
451 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  47.72 
 
 
214 aa  195  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 
219 aa  192  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1785  orotate phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
215 aa  191  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0402  orotate phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
209 aa  191  7e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2888  orotate phosphoribosyltransferase  49.02 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0334106  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  43.48 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1001  orotate phosphoribosyltransferase  43.48 
 
 
234 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1721  orotate phosphoribosyltransferase  39.3 
 
 
211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1987  orotate phosphoribosyltransferase  37.86 
 
 
210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0105796  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4468  orotate phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 
223 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2507  orotate phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 
227 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0138  orotate phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79347  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1929  orotate phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 
232 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2372  orotate phosphoribosyltransferase  35.89 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0580  orotate phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1476  orotate phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0134  orotate phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 
229 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0566  orotate phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 
242 aa  132  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1777  orotate phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
226 aa  131  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693313  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2045  orotate phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0107  orotate phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0219  orotate phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
228 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744558  hitchhiker  0.000000000190609 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2587  orotate phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
228 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3531  orotate phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
228 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0020  orotate phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
228 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3851  orotate phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
228 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3522  orotate phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
228 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.571164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3789  orotate phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
228 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.360033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1968  orotate phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
228 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.174064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3125  orotate phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
228 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0297  orotate phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000108566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2789  orotate phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0317  orotate phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3416  orotate phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0324  orotate phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3111  orotate phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2871  orotate phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.959214  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0244  orotate phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110652 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0236  orotate phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5320  orotate phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
233 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0528  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 
230 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1741  orotate phosphoribosyltransferase  32.84 
 
 
228 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0662938  normal  0.536983 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3676  orotate phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 
228 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0607771  hitchhiker  0.0000000000680378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0281  orotate phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 
228 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0057  orotate phosphoribosyltransferase  32.55 
 
 
232 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1317  orotate phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0056  orotate phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 
253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  0.0416513 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
192 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 
192 aa  95.1  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 
193 aa  89.4  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  28.86 
 
 
474 aa  88.2  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1589  orotate phosphoribosyltransferase  35.59 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
182 aa  79  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
169 aa  77  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  28.49 
 
 
500 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  34.57 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
186 aa  72  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  32.57 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  27.59 
 
 
482 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>