225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0566 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0566  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
242 aa  500  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0056  orotate phosphoribosyltransferase  75.74 
 
 
253 aa  381  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  0.0416513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2507  orotate phosphoribosyltransferase  62.79 
 
 
227 aa  289  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0219  orotate phosphoribosyltransferase  58.59 
 
 
228 aa  280  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744558  hitchhiker  0.000000000190609 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0244  orotate phosphoribosyltransferase  57.27 
 
 
228 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110652 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3416  orotate phosphoribosyltransferase  57.27 
 
 
228 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0236  orotate phosphoribosyltransferase  57.27 
 
 
228 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0297  orotate phosphoribosyltransferase  57.27 
 
 
228 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000108566 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2587  orotate phosphoribosyltransferase  58.15 
 
 
228 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0020  orotate phosphoribosyltransferase  58.15 
 
 
228 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2789  orotate phosphoribosyltransferase  57.27 
 
 
228 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0317  orotate phosphoribosyltransferase  57.27 
 
 
228 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3125  orotate phosphoribosyltransferase  58.15 
 
 
228 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3531  orotate phosphoribosyltransferase  58.15 
 
 
228 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1968  orotate phosphoribosyltransferase  58.15 
 
 
228 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.174064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3789  orotate phosphoribosyltransferase  58.15 
 
 
228 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.360033  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3851  orotate phosphoribosyltransferase  58.15 
 
 
228 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3522  orotate phosphoribosyltransferase  58.15 
 
 
228 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.571164  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3111  orotate phosphoribosyltransferase  58.15 
 
 
228 aa  275  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1476  orotate phosphoribosyltransferase  58.6 
 
 
234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19167  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3676  orotate phosphoribosyltransferase  56.39 
 
 
228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0607771  hitchhiker  0.0000000000680378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0281  orotate phosphoribosyltransferase  56.39 
 
 
228 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2871  orotate phosphoribosyltransferase  56.83 
 
 
228 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.959214  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0057  orotate phosphoribosyltransferase  57.21 
 
 
232 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1317  orotate phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 
230 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2045  orotate phosphoribosyltransferase  53.46 
 
 
232 aa  263  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5320  orotate phosphoribosyltransferase  55 
 
 
233 aa  259  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0324  orotate phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
232 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1929  orotate phosphoribosyltransferase  56.19 
 
 
232 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0580  orotate phosphoribosyltransferase  56.19 
 
 
232 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4468  orotate phosphoribosyltransferase  55.4 
 
 
223 aa  254  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1777  orotate phosphoribosyltransferase  56.19 
 
 
226 aa  254  8e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693313  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1741  orotate phosphoribosyltransferase  55.4 
 
 
228 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0662938  normal  0.536983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2372  orotate phosphoribosyltransferase  53.46 
 
 
226 aa  241  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0107  orotate phosphoribosyltransferase  50.94 
 
 
232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0138  orotate phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
229 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79347  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0134  orotate phosphoribosyltransferase  47.87 
 
 
229 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0528  orotate phosphoribosyltransferase  48.11 
 
 
230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
207 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
213 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  38.21 
 
 
210 aa  143  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 
212 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2181  orotate phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
217 aa  138  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.134132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 
210 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0981  orotate phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0402  orotate phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
209 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1785  orotate phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
215 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
210 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
210 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
210 aa  134  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
210 aa  134  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 
209 aa  132  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  37 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 
209 aa  129  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 
207 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0771  orotate phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 
203 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
217 aa  126  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
214 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1264  orotate phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
203 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
211 aa  124  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1289  orotate phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
203 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.48 
 
 
451 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
219 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  32.71 
 
 
213 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2888  orotate phosphoribosyltransferase  31.73 
 
 
217 aa  118  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0334106  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1353  orotate phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 
210 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  35.91 
 
 
215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1987  orotate phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 
210 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0105796  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1094  orotate phosphoribosyltransferase  30.05 
 
 
212 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1001  orotate phosphoribosyltransferase  33.02 
 
 
234 aa  101  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1721  orotate phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
211 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  23.16 
 
 
201 aa  85.9  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  40.17 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  35.59 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
173 aa  75.1  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 
169 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  28.43 
 
 
474 aa  72  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 
179 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  30.05 
 
 
181 aa  71.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  31.15 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  32.96 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  30.48 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  25.49 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  37.07 
 
 
188 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>