More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1001 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 170 aa  329  1e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  60.12 
 
 		 169 aa  197  7.999999999999999e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0841  orotate phosphoribosyltransferase  62.87 
 
 		 167 aa  191  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.637586 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2360  orotate phosphoribosyltransferase  64.71 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.166662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  54.88 
 
 		 172 aa  157  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  48.77 
 
 		 182 aa  154  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  45.34 
 
 		 166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 		 185 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  45.34 
 
 		 187 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  41.52 
 
 		 185 aa  134  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  40.94 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  43.64 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  41.52 
 
 		 185 aa  130  9e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 		 186 aa  127  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  42.31 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  41.42 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  41.03 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  41.03 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  34.97 
 
 		 482 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0953  orotate phosphoribosyltransferase  40.74 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  37.35 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  39.39 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.98 
 
 		 479 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.98 
 
 		 479 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  39.26 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  39.39 
 
 		 187 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  35.84 
 
 		 474 aa  98.6  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  39.02 
 
 		 213 aa  98.2  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 		 202 aa  97.8  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  37.58 
 
 		 187 aa  97.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.14 
 
 		 477 aa  97.4  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  32.4 
 
 		 201 aa  97.4  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  32.93 
 
 		 195 aa  96.7  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  38.99 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  42.57 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  38.65 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  38.41 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  32.93 
 
 		 500 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 		 201 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  35.06 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  37.74 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  34.32 
 
 		 193 aa  92.8  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  38.56 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 		 191 aa  91.3  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  37.85 
 
 		 178 aa  90.5  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  39.87 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 		 201 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  38.51 
 
 		 204 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  36.88 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 		 177 aa  88.2  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0071  orotate phosphoribosyltransferase  38.29 
 
 		 211 aa  87.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  35.95 
 
 		 176 aa  87.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  36.48 
 
 		 203 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  38.04 
 
 		 208 aa  85.5  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  34.66 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 192 aa  84.7  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 214 aa  84.7  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  37.42 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2026  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 		 245 aa  84.3  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000542739  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 		 191 aa  84  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1589  orotate phosphoribosyltransferase  37.95 
 
 		 193 aa  84  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5123  orotate phosphoribosyltransferase  39.35 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  36.93 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5503  orotate phosphoribosyltransferase  39.35 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5212  orotate phosphoribosyltransferase  39.35 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1895  orotate phosphoribosyltransferase  29.44 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2740  orotate phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6936  orotate phosphoribosyltransferase  43.79 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.824462  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1641  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2069  orotate phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372282  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3928  orotate phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4013  orotate phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03551  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4143  orotate phosphoribosyltransferase  35.57 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00122436  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4120  orotate phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3932  orotate phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0874196  hitchhiker  0.000146436 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4059  orotate phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4067  orotate phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00621989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5012  orotate phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.127395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3950  orotate phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03499  orotate phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0295894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0063  orotate phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03451  hypothetical protein  36.55 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0214857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3851  orotate phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  36 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>