276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0239 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  60.1 
 
 		 212 aa  265  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 		 209 aa  257  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 		 217 aa  251  4.0000000000000004e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  54.46 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  53.37 
 
 		 214 aa  243  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1353  orotate phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  56.16 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  53.69 
 
 		 213 aa  228  5e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  51.69 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  53.96 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 210 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 210 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 		 210 aa  209  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 210 aa  207  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 		 209 aa  204  7e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0981  orotate phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1289  orotate phosphoribosyltransferase  48.74 
 
 		 203 aa  198  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1264  orotate phosphoribosyltransferase  48.74 
 
 		 203 aa  198  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0771  orotate phosphoribosyltransferase  46.23 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 		 213 aa  191  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2181  orotate phosphoribosyltransferase  45.97 
 
 		 217 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.134132  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0402  orotate phosphoribosyltransferase  44.28 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1785  orotate phosphoribosyltransferase  43.13 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 		 210 aa  181  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  41.55 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1094  orotate phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 		 212 aa  174  6e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  40.67 
 
 		 207 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  38.94 
 
 		 211 aa  171  5.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2888  orotate phosphoribosyltransferase  43.07 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0334106  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.42 
 
 		 451 aa  161  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1001  orotate phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1987  orotate phosphoribosyltransferase  38.35 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0105796  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2507  orotate phosphoribosyltransferase  37.86 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0138  orotate phosphoribosyltransferase  36.45 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3676  orotate phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 		 228 aa  131  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0607771  hitchhiker  0.0000000000680378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0281  orotate phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 		 228 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198156 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0107  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0219  orotate phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744558  hitchhiker  0.000000000190609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2871  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.959214  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0134  orotate phosphoribosyltransferase  36.45 
 
 		 229 aa  128  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0057  orotate phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 		 232 aa  128  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1317  orotate phosphoribosyltransferase  36.06 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3789  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 228 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.360033  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2587  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 228 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3851  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 228 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0020  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 228 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3522  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 228 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.571164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1968  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 228 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.174064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3125  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 228 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3531  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 228 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3416  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0297  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1721  orotate phosphoribosyltransferase  37.81 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2789  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0317  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0244  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 228 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110652 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0236  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 228 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4468  orotate phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3111  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0566  orotate phosphoribosyltransferase  32.71 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0528  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1929  orotate phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0580  orotate phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2372  orotate phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1741  orotate phosphoribosyltransferase  33.02 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0662938  normal  0.536983 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0056  orotate phosphoribosyltransferase  34.87 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  0.0416513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2045  orotate phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0324  orotate phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1476  orotate phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5320  orotate phosphoribosyltransferase  31.73 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1777  orotate phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693313  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  34.18 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 		 183 aa  86.3  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  33.16 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1589  orotate phosphoribosyltransferase  38.25 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  28.64 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  30.99 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5738  orotate phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  30.11 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  27.18 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  32.81 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  35.66 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  29.01 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3177  orotate phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>