299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4468 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4468  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1929  orotate phosphoribosyltransferase  82.95 
 
 		 232 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0580  orotate phosphoribosyltransferase  82.95 
 
 		 232 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1777  orotate phosphoribosyltransferase  80.73 
 
 		 226 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693313  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0324  orotate phosphoribosyltransferase  81.57 
 
 		 232 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2372  orotate phosphoribosyltransferase  77.98 
 
 		 226 aa  352  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1741  orotate phosphoribosyltransferase  69.91 
 
 		 228 aa  317  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0662938  normal  0.536983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1476  orotate phosphoribosyltransferase  61.47 
 
 		 234 aa  284  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0057  orotate phosphoribosyltransferase  60.09 
 
 		 232 aa  278  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0138  orotate phosphoribosyltransferase  60.65 
 
 		 229 aa  274  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0134  orotate phosphoribosyltransferase  59.72 
 
 		 229 aa  268  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3111  orotate phosphoribosyltransferase  59.81 
 
 		 228 aa  268  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2587  orotate phosphoribosyltransferase  59.81 
 
 		 228 aa  267  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0020  orotate phosphoribosyltransferase  59.81 
 
 		 228 aa  267  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3851  orotate phosphoribosyltransferase  59.81 
 
 		 228 aa  267  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1968  orotate phosphoribosyltransferase  59.81 
 
 		 228 aa  267  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.174064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3522  orotate phosphoribosyltransferase  59.81 
 
 		 228 aa  267  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.571164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3125  orotate phosphoribosyltransferase  59.81 
 
 		 228 aa  267  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3531  orotate phosphoribosyltransferase  59.81 
 
 		 228 aa  267  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2871  orotate phosphoribosyltransferase  58.41 
 
 		 228 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.959214  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0107  orotate phosphoribosyltransferase  60.38 
 
 		 232 aa  266  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0244  orotate phosphoribosyltransferase  57.94 
 
 		 228 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110652 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3789  orotate phosphoribosyltransferase  59.35 
 
 		 228 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.360033  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0236  orotate phosphoribosyltransferase  57.94 
 
 		 228 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1317  orotate phosphoribosyltransferase  56.31 
 
 		 230 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3676  orotate phosphoribosyltransferase  57.94 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0607771  hitchhiker  0.0000000000680378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0281  orotate phosphoribosyltransferase  57.94 
 
 		 228 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198156 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0219  orotate phosphoribosyltransferase  57.94 
 
 		 228 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744558  hitchhiker  0.000000000190609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5320  orotate phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 		 233 aa  264  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3416  orotate phosphoribosyltransferase  57.94 
 
 		 228 aa  263  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0297  orotate phosphoribosyltransferase  57.94 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2045  orotate phosphoribosyltransferase  56.76 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2789  orotate phosphoribosyltransferase  57.94 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0317  orotate phosphoribosyltransferase  57.94 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0528  orotate phosphoribosyltransferase  59.52 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0566  orotate phosphoribosyltransferase  55.4 
 
 		 242 aa  254  6e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2507  orotate phosphoribosyltransferase  53.15 
 
 		 227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0056  orotate phosphoribosyltransferase  52.58 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  0.0416513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2181  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.134132  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0402  orotate phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 		 209 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1785  orotate phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  42.16 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  38.05 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  36.23 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  39.41 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.75 
 
 		 451 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0981  orotate phosphoribosyltransferase  35.41 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0771  orotate phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1094  orotate phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1289  orotate phosphoribosyltransferase  39.74 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1264  orotate phosphoribosyltransferase  39.74 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 		 210 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 		 210 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2888  orotate phosphoribosyltransferase  36.45 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0334106  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1353  orotate phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 213 aa  122  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1987  orotate phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0105796  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1721  orotate phosphoribosyltransferase  37.75 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  32.99 
 
 		 474 aa  99  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1001  orotate phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 234 aa  95.1  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  26.97 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  37.67 
 
 		 181 aa  87.8  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  33.74 
 
 		 187 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  29.48 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  34.52 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  29.76 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  28.98 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  38.05 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>