172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5320 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5320  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
233 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2045  orotate phosphoribosyltransferase  65.67 
 
 
232 aa  327  8e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2587  orotate phosphoribosyltransferase  67.58 
 
 
228 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0020  orotate phosphoribosyltransferase  67.58 
 
 
228 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3125  orotate phosphoribosyltransferase  67.58 
 
 
228 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3531  orotate phosphoribosyltransferase  67.58 
 
 
228 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1968  orotate phosphoribosyltransferase  67.58 
 
 
228 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.174064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3851  orotate phosphoribosyltransferase  67.58 
 
 
228 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3522  orotate phosphoribosyltransferase  67.58 
 
 
228 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.571164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3789  orotate phosphoribosyltransferase  67.12 
 
 
228 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.360033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1317  orotate phosphoribosyltransferase  64.78 
 
 
230 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2871  orotate phosphoribosyltransferase  63.56 
 
 
228 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.959214  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3111  orotate phosphoribosyltransferase  66.67 
 
 
228 aa  316  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2789  orotate phosphoribosyltransferase  65.61 
 
 
228 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0317  orotate phosphoribosyltransferase  65.61 
 
 
228 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0297  orotate phosphoribosyltransferase  65.61 
 
 
228 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000108566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0219  orotate phosphoribosyltransferase  65.6 
 
 
228 aa  314  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744558  hitchhiker  0.000000000190609 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3416  orotate phosphoribosyltransferase  64.71 
 
 
228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0236  orotate phosphoribosyltransferase  64.25 
 
 
228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0244  orotate phosphoribosyltransferase  64.25 
 
 
228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110652 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3676  orotate phosphoribosyltransferase  63.11 
 
 
228 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0607771  hitchhiker  0.0000000000680378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0281  orotate phosphoribosyltransferase  62.67 
 
 
228 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0057  orotate phosphoribosyltransferase  61.16 
 
 
232 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1476  orotate phosphoribosyltransferase  56.82 
 
 
234 aa  272  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19167  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0056  orotate phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
253 aa  268  5e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  0.0416513 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0107  orotate phosphoribosyltransferase  56.76 
 
 
232 aa  264  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4468  orotate phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
223 aa  264  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1777  orotate phosphoribosyltransferase  58.02 
 
 
226 aa  264  8.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693313  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1929  orotate phosphoribosyltransferase  57.67 
 
 
232 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2372  orotate phosphoribosyltransferase  57.87 
 
 
226 aa  260  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0566  orotate phosphoribosyltransferase  55 
 
 
242 aa  259  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0580  orotate phosphoribosyltransferase  57.21 
 
 
232 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0324  orotate phosphoribosyltransferase  57.01 
 
 
232 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2507  orotate phosphoribosyltransferase  56.74 
 
 
227 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0138  orotate phosphoribosyltransferase  55 
 
 
229 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79347  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0134  orotate phosphoribosyltransferase  55 
 
 
229 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0528  orotate phosphoribosyltransferase  55.61 
 
 
230 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1741  orotate phosphoribosyltransferase  53 
 
 
228 aa  238  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0662938  normal  0.536983 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
207 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2181  orotate phosphoribosyltransferase  39.62 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.134132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 
213 aa  138  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0402  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
209 aa  138  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1785  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
215 aa  138  8.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
210 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  34.63 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  34.63 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2888  orotate phosphoribosyltransferase  35.05 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0334106  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  35.02 
 
 
219 aa  128  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
210 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  33.98 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0981  orotate phosphoribosyltransferase  35.89 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  34.31 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  34.31 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  34.31 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  33.98 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
207 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
209 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1987  orotate phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
210 aa  118  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0105796  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
212 aa  118  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  32.23 
 
 
215 aa  118  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.49 
 
 
451 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  32.55 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1264  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1289  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
214 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0771  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  31.73 
 
 
213 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  30.84 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  36.11 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1094  orotate phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1353  orotate phosphoribosyltransferase  30.05 
 
 
210 aa  105  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1721  orotate phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 
211 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1001  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  32.92 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  33.99 
 
 
474 aa  72.8  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
192 aa  72  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  35.04 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 
179 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1589  orotate phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 
193 aa  62.4  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  28.11 
 
 
477 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
169 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  33.63 
 
 
191 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
185 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  29.46 
 
 
500 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>