More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0289 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
173 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  38.64 
 
 
185 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  40.96 
 
 
179 aa  124  9e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 
185 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 
185 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  37.22 
 
 
181 aa  122  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  36.17 
 
 
500 aa  122  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  40.54 
 
 
191 aa  118  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  36.46 
 
 
182 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  31.05 
 
 
474 aa  115  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  35.23 
 
 
482 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  34.44 
 
 
477 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  35.91 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
191 aa  107  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.89 
 
 
479 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.89 
 
 
479 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2045  orotate phosphoribosyltransferase  31.64 
 
 
232 aa  107  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  37.42 
 
 
166 aa  106  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  34.3 
 
 
192 aa  106  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 
187 aa  104  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
193 aa  103  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0056  orotate phosphoribosyltransferase  26.4 
 
 
253 aa  99.4  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  0.0416513 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 
186 aa  98.2  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2507  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  32.4 
 
 
170 aa  97.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0244  orotate phosphoribosyltransferase  26.55 
 
 
228 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110652 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0236  orotate phosphoribosyltransferase  26.55 
 
 
228 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3416  orotate phosphoribosyltransferase  25.99 
 
 
228 aa  94.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0528  orotate phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3676  orotate phosphoribosyltransferase  26.55 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0607771  hitchhiker  0.0000000000680378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0281  orotate phosphoribosyltransferase  26.55 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198156 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0297  orotate phosphoribosyltransferase  25.42 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000108566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1777  orotate phosphoribosyltransferase  26.5 
 
 
226 aa  93.2  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693313  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2789  orotate phosphoribosyltransferase  25.42 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0317  orotate phosphoribosyltransferase  25.42 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4468  orotate phosphoribosyltransferase  26.97 
 
 
223 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0219  orotate phosphoribosyltransferase  25.42 
 
 
228 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744558  hitchhiker  0.000000000190609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2871  orotate phosphoribosyltransferase  25.42 
 
 
228 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.959214  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0138  orotate phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79347  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
169 aa  89.7  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3111  orotate phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 
228 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1476  orotate phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 
234 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5320  orotate phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
233 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3789  orotate phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 
228 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.360033  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1968  orotate phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 
228 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.174064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2587  orotate phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 
228 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0020  orotate phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 
228 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1929  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  35.03 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3851  orotate phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 
228 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3522  orotate phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 
228 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.571164  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0580  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3125  orotate phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 
228 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3531  orotate phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 
228 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0324  orotate phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 
232 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1589  orotate phosphoribosyltransferase  38.95 
 
 
193 aa  88.6  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2181  orotate phosphoribosyltransferase  29.15 
 
 
217 aa  88.2  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.134132  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1094  orotate phosphoribosyltransferase  34.5 
 
 
212 aa  87.8  9e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0134  orotate phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2372  orotate phosphoribosyltransferase  26.4 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0841  orotate phosphoribosyltransferase  32.92 
 
 
167 aa  87.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.637586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 
175 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  29.08 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  29.08 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0566  orotate phosphoribosyltransferase  23.16 
 
 
242 aa  85.9  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  29.08 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0057  orotate phosphoribosyltransferase  24.16 
 
 
232 aa  85.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  29.5 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  31.64 
 
 
214 aa  85.1  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  29.08 
 
 
207 aa  84.7  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1741  orotate phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
228 aa  84.7  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0662938  normal  0.536983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2888  orotate phosphoribosyltransferase  30 
 
 
217 aa  84.7  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0334106  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.29 
 
 
451 aa  84.7  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1317  orotate phosphoribosyltransferase  25.95 
 
 
230 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0107  orotate phosphoribosyltransferase  28.25 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0953  orotate phosphoribosyltransferase  32 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  29.5 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 
221 aa  82  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>