More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0841 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0841  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 167 aa  331  3e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.637586 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  64.67 
 
 		 169 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  62.87 
 
 		 170 aa  206  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2360  orotate phosphoribosyltransferase  64.02 
 
 		 172 aa  174  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.166662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  54.6 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  45.91 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  44.72 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 		 187 aa  131  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 		 185 aa  124  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 		 191 aa  111  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  36.69 
 
 		 195 aa  108  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  35.98 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  36.53 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0953  orotate phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  39.24 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  37.21 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  37.32 
 
 		 193 aa  98.2  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  32.92 
 
 		 201 aa  97.8  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 		 185 aa  97.4  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  33.9 
 
 		 474 aa  97.1  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.01 
 
 		 482 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  36.16 
 
 		 187 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 		 213 aa  95.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 		 190 aa  94.7  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 		 202 aa  92  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 		 184 aa  90.5  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.4 
 
 		 477 aa  89  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  35.03 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 		 192 aa  88.6  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 		 188 aa  87.8  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  35.03 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 221 aa  85.5  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 214 aa  84.7  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  28.39 
 
 		 479 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  28.39 
 
 		 479 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  35.86 
 
 		 179 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  37.58 
 
 		 187 aa  84.3  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  38.51 
 
 		 178 aa  84  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  37.09 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  36.42 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  29.75 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1641  orotate phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  31.87 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03551  orotate phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  36.69 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1589  orotate phosphoribosyltransferase  39.72 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 		 209 aa  80.9  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  34.84 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  33.71 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03021  orotate phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.0000452779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2026  orotate phosphoribosyltransferase  34.87 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000542739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24961  orotate phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  33.72 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  36.69 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 		 201 aa  77.4  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 219 aa  77.4  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0981  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 209 aa  77.4  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2740  orotate phosphoribosyltransferase  34.84 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2069  orotate phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372282  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  37.21 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1895  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  34.31 
 
 		 217 aa  74.3  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1741  orotate phosphoribosyltransferase  33.13 
 
 		 228 aa  74.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0662938  normal  0.536983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0071  orotate phosphoribosyltransferase  32.6 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0402  orotate phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  33.07 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  30.86 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1785  orotate phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  34.65 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>