239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0277 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
186 aa  367  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  91.4 
 
 
186 aa  333  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  89.25 
 
 
186 aa  326  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03081  orotate phosphoribosyltransferase  75.81 
 
 
192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.691934  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1641  orotate phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 
215 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03551  orotate phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 
193 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  50.83 
 
 
190 aa  193  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  52 
 
 
194 aa  190  9e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03021  orotate phosphoribosyltransferase  51.08 
 
 
194 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.0000452779  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  47.16 
 
 
204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
201 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24961  orotate phosphoribosyltransferase  47.57 
 
 
196 aa  161  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
201 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
203 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
186 aa  153  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  42.53 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
193 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
186 aa  141  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  42.37 
 
 
186 aa  141  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3103  orotate phosphoribosyltransferase  42.7 
 
 
187 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 
208 aa  138  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3708  orotate phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3568  orotate phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0180203  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3634  orotate phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.274017  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5105  orotate phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.077972  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1938  orotate phosphoribosyltransferase  40.8 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1154  orotate phosphoribosyltransferase  40.34 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
183 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2328  orotate phosphoribosyltransferase  43.58 
 
 
182 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1892  orotate phosphoribosyltransferase  43.58 
 
 
182 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1637  orotate phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 
182 aa  122  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  43.18 
 
 
188 aa  122  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
198 aa  120  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2069  orotate phosphoribosyltransferase  41.34 
 
 
182 aa  120  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372282  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1305  orotate phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  35 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3689  orotate phosphoribosyltransferase  35.05 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.477212  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  34.39 
 
 
213 aa  111  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
166 aa  111  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  40.64 
 
 
183 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  35.91 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  35 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
187 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
178 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
187 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1455  orotate phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
185 aa  106  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  33.69 
 
 
191 aa  105  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
177 aa  104  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3008  orotate phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 
177 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
179 aa  102  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
195 aa  101  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1176  orotate phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
195 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 
187 aa  99  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0181  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05620  orotate phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0920693  normal  0.821582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  31.15 
 
 
191 aa  95.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
178 aa  94.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
194 aa  94  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 
191 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2110  orotate phosphoribosyltransferase  34.9 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6936  orotate phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 
184 aa  92  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.824462  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
192 aa  92  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
185 aa  92  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3147  orotate phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 
192 aa  91.7  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2123  orotate phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 
196 aa  91.3  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  37.13 
 
 
186 aa  90.9  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3177  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  38.79 
 
 
215 aa  89.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38490  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 
189 aa  89  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25780  orotate phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
199 aa  89  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  32 
 
 
187 aa  89  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4786  orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
199 aa  88.6  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8390  orotate phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  28.98 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  33.71 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  30.11 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
185 aa  85.1  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2425  orotate phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 
191 aa  85.1  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.205434 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  31.64 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0953  orotate phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35310  orotate phosphoribosyltransferase  36.16 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.238269  normal  0.306388 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  31.64 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5123  orotate phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>