More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0847 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  97.33 
 
 		 187 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  96.77 
 
 		 187 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  90.86 
 
 		 187 aa  341  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  86.02 
 
 		 213 aa  326  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  82.7 
 
 		 185 aa  317  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  55.31 
 
 		 187 aa  194  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2069  orotate phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1938  orotate phosphoribosyltransferase  43.65 
 
 		 182 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1637  orotate phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  43.89 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  39.67 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  41.53 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  42.46 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1154  orotate phosphoribosyltransferase  42.54 
 
 		 182 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  44.03 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  40.66 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  43.18 
 
 		 192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2328  orotate phosphoribosyltransferase  43.41 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1892  orotate phosphoribosyltransferase  43.41 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  42.5 
 
 		 184 aa  127  7.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  36.7 
 
 		 191 aa  127  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  41.01 
 
 		 179 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3177  orotate phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 		 184 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  39.67 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3103  orotate phosphoribosyltransferase  37.78 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  39.55 
 
 		 193 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3708  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 		 178 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3634  orotate phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.274017  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3568  orotate phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0180203  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  36.51 
 
 		 188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  37.84 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0181  orotate phosphoribosyltransferase  37.22 
 
 		 178 aa  117  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03021  orotate phosphoribosyltransferase  34.41 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.0000452779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3689  orotate phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.477212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 190 aa  114  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  34.05 
 
 		 206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  33.89 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  40.85 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5105  orotate phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.077972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  36.16 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  38.98 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25780  orotate phosphoribosyltransferase  38.38 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  36.16 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  39.33 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05620  orotate phosphoribosyltransferase  40.8 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0920693  normal  0.821582 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3147  orotate phosphoribosyltransferase  38.76 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  35.67 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  36.75 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8390  orotate phosphoribosyltransferase  40.44 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.353067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4069  orotate phosphoribosyltransferase  39.31 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  37.78 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3008  orotate phosphoribosyltransferase  35.09 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6936  orotate phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.824462  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03081  orotate phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.691934  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1176  orotate phosphoribosyltransferase  38.59 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24961  orotate phosphoribosyltransferase  37.63 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38490  orotate phosphoribosyltransferase  39.31 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0125  orotate phosphoribosyltransferase  39.63 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0130  orotate phosphoribosyltransferase  39.63 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000251206 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  35.54 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  39.39 
 
 		 170 aa  99  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2110  orotate phosphoribosyltransferase  36.56 
 
 		 189 aa  98.6  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  33.15 
 
 		 208 aa  98.6  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03551  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1641  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1305  orotate phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1455  orotate phosphoribosyltransferase  38.76 
 
 		 185 aa  94.7  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4786  orotate phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288171  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  35.98 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2425  orotate phosphoribosyltransferase  38.25 
 
 		 191 aa  91.7  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.205434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35310  orotate phosphoribosyltransferase  38.8 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.238269  normal  0.306388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  34.32 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1944  orotate phosphoribosyltransferase  37.64 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2123  orotate phosphoribosyltransferase  36.5 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 		 178 aa  87.8  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 		 175 aa  87.8  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5893  phosphoribosyltransferase  38.61 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>