More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2302 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
178 aa  337  5e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
178 aa  134  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
188 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  51.39 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  42.6 
 
 
180 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
180 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
191 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1199  pyrE protein  45.71 
 
 
178 aa  127  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  47.53 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  39.51 
 
 
208 aa  112  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  38.65 
 
 
179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 
206 aa  111  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
204 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
203 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 
201 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  36.53 
 
 
176 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  46.21 
 
 
166 aa  105  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  42.47 
 
 
188 aa  105  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
174 aa  105  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 
172 aa  104  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
208 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  43.83 
 
 
202 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
170 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4354  orotate phosphoribosyltransferase  48.94 
 
 
179 aa  101  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  36.42 
 
 
185 aa  101  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  38.61 
 
 
185 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 
185 aa  98.2  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  34.08 
 
 
185 aa  97.4  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  37.41 
 
 
182 aa  95.1  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  38.29 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0953  orotate phosphoribosyltransferase  46.81 
 
 
183 aa  94.4  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  38.04 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  34.57 
 
 
191 aa  92  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
169 aa  92  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  36.91 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.08 
 
 
477 aa  90.5  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  36.53 
 
 
184 aa  90.1  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
185 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3103  orotate phosphoribosyltransferase  36.51 
 
 
187 aa  88.6  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
187 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 
179 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  30.52 
 
 
479 aa  88.2  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  30.52 
 
 
479 aa  88.2  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 
210 aa  87.8  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  35.59 
 
 
194 aa  87.8  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 
187 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 
187 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 
181 aa  87.8  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
210 aa  87.4  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
210 aa  87.4  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
210 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
210 aa  87  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 
210 aa  87  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
210 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  34.66 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
210 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  34.92 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  32.95 
 
 
210 aa  86.3  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  32.85 
 
 
482 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  32.95 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03021  orotate phosphoribosyltransferase  35.6 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.0000452779  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
186 aa  84.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  34.52 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3708  orotate phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2069  orotate phosphoribosyltransferase  33.71 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  37.85 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03081  orotate phosphoribosyltransferase  34.94 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.691934  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1830  orotate phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131476  normal  0.0283563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3568  orotate phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0180203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  38.76 
 
 
219 aa  81.3  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  35.25 
 
 
221 aa  81.3  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  35.8 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3634  orotate phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.274017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  37.22 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1641  orotate phosphoribosyltransferase  41.01 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3177  orotate phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1154  orotate phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  36 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  35.63 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03551  orotate phosphoribosyltransferase  41.01 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 
198 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1637  orotate phosphoribosyltransferase  33.51 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>