More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6071 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
175 aa  338  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  80.46 
 
 
178 aa  271  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
176 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4354  orotate phosphoribosyltransferase  60.36 
 
 
179 aa  180  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  52.12 
 
 
180 aa  173  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 
180 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
180 aa  170  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
188 aa  167  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1199  pyrE protein  51.2 
 
 
178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1830  orotate phosphoribosyltransferase  62.72 
 
 
185 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131476  normal  0.0283563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  51.39 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  46.3 
 
 
186 aa  125  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
191 aa  115  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
182 aa  115  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  44.16 
 
 
187 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
174 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  39.31 
 
 
176 aa  107  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 
179 aa  105  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  38.06 
 
 
166 aa  104  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 
191 aa  103  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0953  orotate phosphoribosyltransferase  43.14 
 
 
183 aa  101  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  38.56 
 
 
181 aa  101  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  36.48 
 
 
206 aa  96.3  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
185 aa  95.5  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
185 aa  95.5  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
185 aa  94  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  36.6 
 
 
169 aa  93.2  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
185 aa  92  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  38.56 
 
 
170 aa  91.7  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  35.5 
 
 
474 aa  91.3  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 
203 aa  90.9  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 
188 aa  90.9  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  37.21 
 
 
204 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
202 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  37.23 
 
 
186 aa  89  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  35.51 
 
 
193 aa  89  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
195 aa  88.6  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  37.11 
 
 
173 aa  88.2  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 
187 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 
201 aa  87.8  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 
213 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  36.11 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  40.52 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  40.68 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  34.52 
 
 
186 aa  84.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
185 aa  84.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03081  orotate phosphoribosyltransferase  34.97 
 
 
192 aa  84.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.691934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  37.66 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2888  orotate phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0334106  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.41 
 
 
482 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  30.82 
 
 
479 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  30.82 
 
 
479 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1938  orotate phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  35.09 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3103  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  38.51 
 
 
192 aa  79  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.51 
 
 
477 aa  79  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  37.59 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  37.59 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2069  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372282  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1641  orotate phosphoribosyltransferase  37.75 
 
 
215 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24961  orotate phosphoribosyltransferase  38.99 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  37.84 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03551  orotate phosphoribosyltransferase  37.75 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0566  orotate phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  36.03 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  32.22 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0154  orotate phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  34.06 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1637  orotate phosphoribosyltransferase  32.22 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  36.89 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  32.81 
 
 
221 aa  74.7  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1929  orotate phosphoribosyltransferase  38.84 
 
 
232 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  34.22 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0580  orotate phosphoribosyltransferase  38.84 
 
 
232 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1154  orotate phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.94 
 
 
500 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0113  orotate phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1777  orotate phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693313  normal  0.186434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>