More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2403 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 
451 aa  918    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2664  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  51.32 
 
 
235 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  55.12 
 
 
207 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0402  orotate phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
209 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1785  orotate phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
215 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0684  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  43.33 
 
 
244 aa  203  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595201  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4051  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.79 
 
 
232 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1278  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  41.95 
 
 
239 aa  202  9e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3960  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.61 
 
 
234 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00328038  hitchhiker  0.000886746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2797  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.74 
 
 
241 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212231  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3908  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.61 
 
 
234 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
207 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0981  orotate phosphoribosyltransferase  49.02 
 
 
209 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1676  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.1 
 
 
240 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  47.26 
 
 
210 aa  197  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
209 aa  197  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1461  orotidine 5`-phosphate decarboxylase  42.19 
 
 
239 aa  196  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190153  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 
213 aa  195  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1866  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.59 
 
 
241 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1687  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.85 
 
 
245 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.660624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003024  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.92 
 
 
233 aa  194  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000599953  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2068  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.67 
 
 
243 aa  194  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1380  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.98 
 
 
229 aa  192  8e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2463  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.54 
 
 
231 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000296014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2761  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.55 
 
 
277 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  46.27 
 
 
211 aa  191  2.9999999999999997e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2141  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  42.67 
 
 
238 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4196  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.93 
 
 
244 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1376  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.05 
 
 
229 aa  189  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1288  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.81 
 
 
231 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.536471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.55 
 
 
237 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.872566 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1263  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.81 
 
 
231 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.224772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0924  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.34 
 
 
238 aa  189  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2077  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.43 
 
 
231 aa  189  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  44.06 
 
 
207 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0944  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.79 
 
 
247 aa  189  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000217759  normal  0.240259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1355  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  41.6 
 
 
239 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000760656  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0730  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.38 
 
 
234 aa  189  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000744541 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02856  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.05 
 
 
233 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1264  orotate phosphoribosyltransferase  46 
 
 
203 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1289  orotate phosphoribosyltransferase  46 
 
 
203 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1201  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.64 
 
 
236 aa  187  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2315  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.92 
 
 
233 aa  187  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0273911  hitchhiker  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  46.97 
 
 
210 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1757  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.13 
 
 
231 aa  187  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0566904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
210 aa  186  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  46.46 
 
 
210 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1501  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.24 
 
 
231 aa  186  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  46.97 
 
 
210 aa  186  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  46.46 
 
 
210 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0771  orotate phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
203 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  46.46 
 
 
210 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  46.46 
 
 
210 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.71 
 
 
232 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.881435  normal  0.442892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1067  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.71 
 
 
232 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2294  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.73 
 
 
234 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000688308  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1335  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.32 
 
 
240 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805853 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  46.46 
 
 
210 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  46.46 
 
 
210 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
221 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1031  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.17 
 
 
236 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0374618  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2681  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.25 
 
 
245 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0446  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.34 
 
 
242 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733361  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1981  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.85 
 
 
231 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191461  unclonable  0.0000000000644794 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
210 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0770  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.69 
 
 
230 aa  183  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
210 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2890  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.89 
 
 
240 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2225  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.06 
 
 
234 aa  183  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000264072  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0645  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.45 
 
 
236 aa  183  6e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1394  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.13 
 
 
233 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228607  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1532  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.45 
 
 
236 aa  183  6e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.41 
 
 
231 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  45.32 
 
 
209 aa  183  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2888  orotate phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 
217 aa  182  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0334106  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1815  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.13 
 
 
233 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253653  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2569  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.06 
 
 
240 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2155  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.77 
 
 
236 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0463695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1928  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.97 
 
 
231 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128014  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1417  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.69 
 
 
233 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.909746  normal  0.120698 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2640  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.17 
 
 
247 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00027729  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2353  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  39.74 
 
 
271 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3896  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.13 
 
 
233 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0903268 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2119  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.79 
 
 
232 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000535005  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  45.55 
 
 
209 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1736  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.23 
 
 
244 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000217643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3009  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.99 
 
 
234 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00223674  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3220  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.55 
 
 
235 aa  180  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1958  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.66 
 
 
231 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000470134  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2070  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.97 
 
 
231 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000195505  unclonable  0.0000000000022204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2074  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.97 
 
 
231 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000167126  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2038  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.41 
 
 
231 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000333047  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1740  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.7 
 
 
233 aa  179  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000416133  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 
212 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0883  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  40.26 
 
 
252 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2275  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.97 
 
 
231 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000296065  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1547  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40 
 
 
241 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2339  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.54 
 
 
231 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0256145  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2398  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.15 
 
 
231 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2392  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.23 
 
 
231 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000113777  unclonable  0.00000908556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>