More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4002 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
176 aa  347  6e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  42.59 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  42.04 
 
 
191 aa  125  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  42.68 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  43.67 
 
 
215 aa  118  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0953  orotate phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 
183 aa  112  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
180 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  40.52 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  40.52 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  40.52 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 
178 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  39.31 
 
 
175 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
179 aa  106  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  36.53 
 
 
178 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
166 aa  102  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  36.24 
 
 
176 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  34.94 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 
185 aa  97.4  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  34.94 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
173 aa  95.5  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 
181 aa  94  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.01 
 
 
479 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.01 
 
 
479 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  36.94 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1199  pyrE protein  42.48 
 
 
178 aa  92  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
187 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  32.28 
 
 
482 aa  87.8  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 
191 aa  87.4  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  34.97 
 
 
213 aa  87  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  35.53 
 
 
191 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  34.23 
 
 
192 aa  87  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0841  orotate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
167 aa  85.1  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.637586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
193 aa  84.7  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 
183 aa  84.3  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  32.43 
 
 
500 aa  83.6  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4354  orotate phosphoribosyltransferase  36.3 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  32.94 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  29.3 
 
 
474 aa  82.4  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  33.13 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  33.13 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  32.68 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  34.55 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  33.13 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0107  orotate phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  32.93 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 
189 aa  77.4  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
206 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  25.48 
 
 
477 aa  75.5  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
204 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
219 aa  74.3  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0134  orotate phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
229 aa  74.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  33.95 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0138  orotate phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79347  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1176  orotate phosphoribosyltransferase  34.19 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1476  orotate phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  35.21 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5503  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
195 aa  72  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5123  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 
193 aa  72  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5212  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5738  orotate phosphoribosyltransferase  35.53 
 
 
195 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2360  orotate phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.166662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1084  orotate phosphoribosyltransferase  36.42 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.668001 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0168  orotate phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03021  orotate phosphoribosyltransferase  28.74 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.0000452779  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1777  orotate phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693313  normal  0.186434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>