More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4354 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4354  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 179 aa  350  7e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  60.36 
 
 		 175 aa  198  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1830  orotate phosphoribosyltransferase  76.74 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131476  normal  0.0283563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  58.62 
 
 		 178 aa  197  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 180 aa  171  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 180 aa  171  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 		 188 aa  167  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1199  pyrE protein  52.98 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  42.14 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  48.94 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  37.66 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  38.01 
 
 		 206 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  37.01 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 		 185 aa  99  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 		 185 aa  97.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  38.31 
 
 		 166 aa  97.4  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0953  orotate phosphoribosyltransferase  39.87 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  41.03 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  36.3 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  35.4 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 187 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 		 213 aa  88.2  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 		 170 aa  87.8  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 192 aa  87.8  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  38.41 
 
 		 193 aa  87.8  8e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 		 208 aa  87.4  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  35.26 
 
 		 204 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 		 174 aa  84.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  35.06 
 
 		 201 aa  84.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  39.31 
 
 		 187 aa  84.3  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 		 185 aa  84.3  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  35.06 
 
 		 201 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  33.96 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  35.33 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  39.86 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  30.06 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  38.98 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0181  orotate phosphoribosyltransferase  40.88 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  40.36 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  34.42 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  34.57 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  41.89 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  32.05 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 		 191 aa  77.4  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0125  orotate phosphoribosyltransferase  45.26 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  37.19 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  29.41 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4786  orotate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288171  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  35.76 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  29.81 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  29.81 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  37.35 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8390  orotate phosphoribosyltransferase  40.27 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.353067 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 		 213 aa  74.3  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4069  orotate phosphoribosyltransferase  39.39 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  35.26 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25780  orotate phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1637  orotate phosphoribosyltransferase  34.18 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1589  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3008  orotate phosphoribosyltransferase  42.55 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 		 207 aa  72  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0130  orotate phosphoribosyltransferase  43.8 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000251206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  33.88 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1938  orotate phosphoribosyltransferase  34.55 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  35.54 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  29.24 
 
 		 477 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>