More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1084 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1084  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
196 aa  394  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.668001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5738  orotate phosphoribosyltransferase  95.19 
 
 
195 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5503  orotate phosphoribosyltransferase  80.21 
 
 
192 aa  313  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5123  orotate phosphoribosyltransferase  80.21 
 
 
192 aa  313  8e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5212  orotate phosphoribosyltransferase  80.21 
 
 
192 aa  313  8e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1455  orotate phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
185 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3177  orotate phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 
184 aa  94.4  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5105  orotate phosphoribosyltransferase  39.63 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.077972  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  33.71 
 
 
198 aa  88.6  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3568  orotate phosphoribosyltransferase  38.37 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0180203  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3634  orotate phosphoribosyltransferase  37.79 
 
 
189 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.274017  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
190 aa  84.7  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1938  orotate phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3708  orotate phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  30.9 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  40.29 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1154  orotate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2069  orotate phosphoribosyltransferase  33.71 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1637  orotate phosphoribosyltransferase  33.74 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  35.67 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
203 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  36.25 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  35.46 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03021  orotate phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.0000452779  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  31.87 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0181  orotate phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  31.87 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  30.68 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  35.54 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3689  orotate phosphoribosyltransferase  30.27 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.477212  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  29.7 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  36.42 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  30.68 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1176  orotate phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2123  orotate phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1641  orotate phosphoribosyltransferase  32.1 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5893  phosphoribosyltransferase  42.75 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03551  orotate phosphoribosyltransferase  32.1 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  30.49 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03081  orotate phosphoribosyltransferase  29.34 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.691934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  30.11 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3008  orotate phosphoribosyltransferase  33.51 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
172 aa  70.9  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  31.52 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  30.21 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  34.57 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  35 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.67 
 
 
451 aa  68.6  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  36.57 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  33.76 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1892  orotate phosphoribosyltransferase  39.5 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2328  orotate phosphoribosyltransferase  39.5 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8390  orotate phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  39.25 
 
 
173 aa  67  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1785  orotate phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  27.65 
 
 
474 aa  65.5  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0528  orotate phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0402  orotate phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>