More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2048 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
191 aa  384  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  80.54 
 
 
193 aa  310  5.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  79.46 
 
 
188 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  77.84 
 
 
188 aa  301  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  77.3 
 
 
195 aa  286  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  73.51 
 
 
193 aa  286  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  67.93 
 
 
193 aa  265  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  54.05 
 
 
191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  58.7 
 
 
201 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  57.38 
 
 
191 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  54.4 
 
 
190 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  56.28 
 
 
193 aa  209  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  55.49 
 
 
191 aa  208  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  53.55 
 
 
190 aa  203  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  52.46 
 
 
193 aa  201  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  51.09 
 
 
189 aa  191  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  49.17 
 
 
187 aa  186  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  49.17 
 
 
187 aa  186  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  52.49 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
195 aa  176  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  44.15 
 
 
196 aa  168  6e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  44.32 
 
 
195 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  45.74 
 
 
195 aa  164  9e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  43.89 
 
 
187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
187 aa  159  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  45 
 
 
183 aa  158  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  44.57 
 
 
200 aa  157  7e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 
196 aa  157  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 
202 aa  156  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  42.31 
 
 
189 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  41.99 
 
 
188 aa  155  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 
189 aa  155  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  41.27 
 
 
191 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  43.43 
 
 
202 aa  154  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 
195 aa  154  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  44.69 
 
 
190 aa  153  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 
196 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  39.39 
 
 
202 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 
202 aa  147  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
202 aa  147  9e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  42.02 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  40.33 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  38.61 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
202 aa  144  9e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  39.23 
 
 
198 aa  142  3e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  37.37 
 
 
202 aa  141  7e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  43.85 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  38.17 
 
 
194 aa  138  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  42.02 
 
 
196 aa  138  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  37.13 
 
 
202 aa  138  6e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  37.89 
 
 
206 aa  137  7.999999999999999e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
196 aa  135  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 
196 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 
196 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  39.46 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 
196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 
196 aa  131  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  37.63 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  37.63 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  36.56 
 
 
192 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  39.25 
 
 
199 aa  121  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 
192 aa  107  7.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  35.05 
 
 
216 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  35.86 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  34.44 
 
 
198 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  32.97 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 
169 aa  64.3  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  32.3 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  32.35 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5503  orotate phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5123  orotate phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5212  orotate phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0841  orotate phosphoribosyltransferase  38.03 
 
 
167 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.637586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5738  orotate phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  30.12 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3734  hypothetical protein  25.93 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 
202 aa  58.5  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 
174 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  31.5 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>