More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2806 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  82.98 
 
 		 188 aa  329  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  79.68 
 
 		 193 aa  321  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  79.46 
 
 		 191 aa  305  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  81.28 
 
 		 195 aa  304  5.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  72.34 
 
 		 193 aa  299  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  66.3 
 
 		 193 aa  267  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  55.19 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  57.92 
 
 		 191 aa  222  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  56.04 
 
 		 191 aa  222  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  57.07 
 
 		 201 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  51.65 
 
 		 190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 		 193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  52.46 
 
 		 190 aa  207  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  49.73 
 
 		 193 aa  206  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 		 187 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 		 187 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  48.66 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 		 189 aa  187  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  42.47 
 
 		 195 aa  174  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  43.89 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  42.78 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 		 187 aa  171  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  43.23 
 
 		 195 aa  171  7.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  43.58 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  44.13 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 		 196 aa  164  5e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  42.39 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  41.8 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  40.32 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  38.17 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 		 190 aa  151  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  41.12 
 
 		 202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  41.53 
 
 		 196 aa  151  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 		 191 aa  150  8e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  42.39 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  39.56 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  41.41 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  41.58 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  37.88 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 194 aa  141  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  36.61 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  39.36 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 		 192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 202 aa  137  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  38.17 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  40.86 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 		 202 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  36.65 
 
 		 196 aa  134  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 		 206 aa  133  9.999999999999999e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  37.63 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  36.17 
 
 		 196 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  36.56 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  36.56 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  33.15 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  32.4 
 
 		 192 aa  112  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 216 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  36.11 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  33.88 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5738  orotate phosphoribosyltransferase  35.77 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5503  orotate phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5123  orotate phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  25.42 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5212  orotate phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  33.76 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3734  hypothetical protein  23.83 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  27.97 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>