172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0284 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  98.51 
 
 
202 aa  403  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  96.53 
 
 
202 aa  394  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  87.62 
 
 
202 aa  362  2e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  78.71 
 
 
202 aa  325  2.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  75.74 
 
 
202 aa  321  4e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  75.25 
 
 
202 aa  311  4.999999999999999e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  75.25 
 
 
202 aa  311  4.999999999999999e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  67.82 
 
 
202 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  60.4 
 
 
202 aa  247  8e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 
189 aa  171  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  43.88 
 
 
190 aa  157  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  43.52 
 
 
192 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  43.52 
 
 
192 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 
201 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
191 aa  154  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  43.15 
 
 
196 aa  151  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  40.8 
 
 
189 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
188 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  37.81 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
191 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  41.5 
 
 
191 aa  145  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  38.19 
 
 
187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  38.19 
 
 
187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  37.76 
 
 
190 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  37.95 
 
 
193 aa  141  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  38.27 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  39.8 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  39.7 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  39.7 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 
195 aa  139  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  37.95 
 
 
196 aa  138  7e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  39.09 
 
 
188 aa  138  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 
188 aa  137  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  36.04 
 
 
191 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  38.97 
 
 
194 aa  135  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
195 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  38.42 
 
 
199 aa  131  6e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
199 aa  131  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 
198 aa  131  7.999999999999999e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  41.12 
 
 
200 aa  124  6e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  37.24 
 
 
194 aa  124  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  37.75 
 
 
196 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  36.68 
 
 
196 aa  122  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
196 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  37.75 
 
 
196 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  37.88 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  35 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  33.16 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  36.76 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  31.66 
 
 
187 aa  112  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 
190 aa  112  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
183 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  31.66 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  34.02 
 
 
194 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  30.93 
 
 
189 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
192 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
192 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
192 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  26.18 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  25.74 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1353  orotate phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
210 aa  62.4  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 
193 aa  61.6  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 
187 aa  61.6  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 
215 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 
181 aa  54.7  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  26.06 
 
 
213 aa  54.7  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  26.86 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 
185 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  26.74 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  26.25 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3734  hypothetical protein  25.51 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  26.86 
 
 
185 aa  52.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  25.98 
 
 
482 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 
202 aa  51.6  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  26.87 
 
 
479 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  26.87 
 
 
479 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  25.61 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  27.48 
 
 
500 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
175 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  25.74 
 
 
171 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  26.98 
 
 
177 aa  48.9  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>