299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0269 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
188 aa  377  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
187 aa  237  6.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
187 aa  237  6.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  54.21 
 
 
195 aa  206  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  48.91 
 
 
193 aa  191  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
191 aa  189  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  48.07 
 
 
190 aa  184  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  47.54 
 
 
192 aa  184  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  47.54 
 
 
192 aa  184  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 
201 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  46.96 
 
 
190 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  49.21 
 
 
189 aa  178  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
195 aa  176  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 
189 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  45.3 
 
 
191 aa  174  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
191 aa  174  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
193 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  43.85 
 
 
193 aa  168  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  44.86 
 
 
191 aa  167  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 
193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  45.05 
 
 
196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  45.65 
 
 
199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  45.11 
 
 
198 aa  160  8.000000000000001e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  41.99 
 
 
193 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
183 aa  158  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  41.5 
 
 
202 aa  155  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  41.99 
 
 
191 aa  155  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  49.73 
 
 
200 aa  153  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 
202 aa  153  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  40.32 
 
 
188 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  39.46 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  44 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  38.17 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
202 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  43 
 
 
202 aa  149  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  40.22 
 
 
190 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  44 
 
 
202 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  43.41 
 
 
196 aa  148  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
202 aa  147  7e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 
195 aa  147  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 
187 aa  145  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  38.14 
 
 
189 aa  145  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  38.59 
 
 
187 aa  144  9e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 
206 aa  141  5e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  38.33 
 
 
187 aa  141  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  41.5 
 
 
202 aa  140  9e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  37.84 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  39 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  37.63 
 
 
195 aa  139  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  39 
 
 
202 aa  139  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  40.93 
 
 
194 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  38.97 
 
 
196 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  38.97 
 
 
196 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 
194 aa  134  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 
196 aa  134  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  38.97 
 
 
196 aa  134  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
196 aa  130  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  38.97 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  38.74 
 
 
196 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  38.8 
 
 
192 aa  124  7e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 
192 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 
192 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 
192 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  34.44 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 
216 aa  99.8  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  25.18 
 
 
187 aa  62.4  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
191 aa  62.4  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 
178 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 
166 aa  60.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 
198 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0181  orotate phosphoribosyltransferase  27.16 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
173 aa  58.5  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
182 aa  58.2  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0130  orotate phosphoribosyltransferase  27.54 
 
 
179 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000251206 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
195 aa  54.7  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
181 aa  54.3  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0125  orotate phosphoribosyltransferase  26.81 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  27.14 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0547  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  30.56 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1637  orotate phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  24.05 
 
 
178 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  25.49 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  27.66 
 
 
191 aa  52  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
193 aa  52  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  28.78 
 
 
221 aa  51.6  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3103  orotate phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 
187 aa  51.2  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  24.09 
 
 
174 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 
214 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  22.46 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  26.06 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>