More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2572 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
183 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  78.69 
 
 
190 aa  276  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  56.15 
 
 
199 aa  200  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 
193 aa  189  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 
201 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  47.51 
 
 
189 aa  179  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  44.69 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  44.63 
 
 
190 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  44.13 
 
 
188 aa  166  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  44.13 
 
 
193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 
191 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  41.62 
 
 
191 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  45 
 
 
191 aa  158  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
188 aa  158  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  42.7 
 
 
195 aa  156  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
193 aa  155  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
189 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  41.34 
 
 
193 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  41.57 
 
 
191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  40.78 
 
 
193 aa  154  8e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  42.54 
 
 
195 aa  154  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  43.5 
 
 
192 aa  153  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  43.5 
 
 
192 aa  153  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  41.34 
 
 
188 aa  152  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
195 aa  147  9e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 
187 aa  145  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 
195 aa  144  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  45 
 
 
195 aa  143  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
187 aa  142  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
187 aa  142  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
189 aa  141  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  43.1 
 
 
194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
202 aa  137  8.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
196 aa  136  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
196 aa  135  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  39.31 
 
 
196 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  38.73 
 
 
196 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
191 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 
196 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  38.73 
 
 
196 aa  131  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  40.68 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 
192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  38.73 
 
 
196 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 
194 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  39.78 
 
 
189 aa  124  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  38.02 
 
 
202 aa  122  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  36.78 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 
202 aa  117  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  36.78 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 
194 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
202 aa  115  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  31.77 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  33.85 
 
 
202 aa  114  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  31.77 
 
 
202 aa  114  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  33.72 
 
 
206 aa  101  7e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  30.29 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
194 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  28.25 
 
 
198 aa  94  1e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 
216 aa  91.3  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  33.95 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  34.72 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 
195 aa  61.2  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
175 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1199  pyrE protein  32.37 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  28.98 
 
 
182 aa  58.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 
187 aa  58.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
198 aa  57  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2026  orotate phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
245 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000542739  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08870  orotate phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 
226 aa  55.5  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012561  normal  0.459623 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4143  orotate phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
213 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00122436  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0528  orotate phosphoribosyltransferase  32.22 
 
 
231 aa  54.7  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.560571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0041  orotate phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
225 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0035  orotate phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
225 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5012  orotate phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.127395  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4067  orotate phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00621989  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0063  orotate phosphoribosyltransferase  32.48 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160441  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3977  orotate phosphoribosyltransferase  32.48 
 
 
213 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  27.52 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  34.84 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0069  orotate phosphoribosyltransferase  32.48 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000170079  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0097  orotate phosphoribosyltransferase  32.48 
 
 
213 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0812826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>