More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_976 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  98.93 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  96.26 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  50.27 
 
 		 195 aa  201  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  48.11 
 
 		 193 aa  180  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  45 
 
 		 193 aa  175  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 		 188 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  46.49 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  43.55 
 
 		 191 aa  168  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 		 190 aa  167  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  42.22 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  42.22 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  45 
 
 		 193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  43.89 
 
 		 191 aa  164  9e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  44.75 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 		 191 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  39.44 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  43.89 
 
 		 195 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  39.89 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  39.89 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  40.31 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  37.16 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  37.16 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 		 195 aa  141  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  39.68 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  36.7 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 		 196 aa  134  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  37.78 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 		 196 aa  131  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 		 194 aa  130  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 196 aa  130  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 		 196 aa  130  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  35.18 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  35.33 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  38.3 
 
 		 196 aa  124  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  38.92 
 
 		 200 aa  123  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  36.7 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  35.18 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  35.68 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  32.66 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  32.66 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  32.66 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  32.11 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  34.02 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 206 aa  98.2  6e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  36.22 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  36.29 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  32.68 
 
 		 233 aa  60.8  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  28.17 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0057  orotate phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  34.81 
 
 		 477 aa  57.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  29.19 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  29.19 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0380  xanthine phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000351735  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>