263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2068 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
202 aa  413  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  69.8 
 
 
202 aa  298  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  67.82 
 
 
202 aa  285  2e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  65.84 
 
 
202 aa  280  7.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  60.89 
 
 
202 aa  265  5e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  61.88 
 
 
202 aa  263  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  60.4 
 
 
202 aa  257  7e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  60.4 
 
 
202 aa  257  9e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  59.9 
 
 
202 aa  256  1e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  60.4 
 
 
202 aa  256  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  47.5 
 
 
189 aa  180  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  45.92 
 
 
190 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  44.22 
 
 
201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  43.94 
 
 
195 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 
191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  41.41 
 
 
190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  43.43 
 
 
191 aa  159  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  42.71 
 
 
193 aa  158  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  43.59 
 
 
193 aa  158  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 
193 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  43.15 
 
 
191 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  41.12 
 
 
188 aa  155  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  41.12 
 
 
188 aa  154  8e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  39.7 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  39.7 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  44.28 
 
 
189 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  39 
 
 
188 aa  148  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  42.64 
 
 
194 aa  148  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  41.8 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  41.8 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 
193 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
196 aa  144  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 
196 aa  144  8.000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  38.74 
 
 
191 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  44.1 
 
 
191 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 
195 aa  141  7e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  41.21 
 
 
196 aa  136  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  35.86 
 
 
195 aa  135  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 
200 aa  134  8e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  41.03 
 
 
196 aa  134  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  39.41 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  39.7 
 
 
189 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  38.02 
 
 
183 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  38.62 
 
 
198 aa  128  7.000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  37.95 
 
 
193 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  37.19 
 
 
195 aa  125  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
199 aa  125  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  38 
 
 
192 aa  123  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  36.46 
 
 
190 aa  121  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  39.69 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  39.79 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  38 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  37 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  37 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  32.66 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  37.44 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  37.44 
 
 
196 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 
189 aa  115  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 
196 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  35.79 
 
 
194 aa  111  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  41.48 
 
 
206 aa  111  9e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  30.73 
 
 
192 aa  94  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  30.15 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_002950  PG1353  orotate phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  27.94 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  32.84 
 
 
173 aa  64.7  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1289  orotate phosphoribosyltransferase  30.06 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  27.5 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1264  orotate phosphoribosyltransferase  30.06 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  26.84 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  30.06 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0981  orotate phosphoribosyltransferase  26.21 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
213 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 
181 aa  58.2  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
177 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  24.38 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1785  orotate phosphoribosyltransferase  25 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0402  orotate phosphoribosyltransferase  25 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 
183 aa  56.6  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 
201 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  31.91 
 
 
187 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  27.82 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 
186 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>