More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2430 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  71.43 
 
 		 193 aa  293  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  67.2 
 
 		 193 aa  281  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  66.3 
 
 		 188 aa  267  5e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  67.93 
 
 		 191 aa  265  2.9999999999999995e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  65.22 
 
 		 188 aa  263  8e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  66.84 
 
 		 195 aa  254  6e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  57.07 
 
 		 191 aa  223  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 		 201 aa  218  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  56.04 
 
 		 191 aa  217  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  51.58 
 
 		 193 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 		 193 aa  203  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  50.79 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  50.53 
 
 		 189 aa  194  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  48.42 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  45.79 
 
 		 195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  45.79 
 
 		 195 aa  174  9e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  43.72 
 
 		 187 aa  168  6e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  43.59 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  45 
 
 		 187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 		 188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 189 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 187 aa  164  9e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  41.44 
 
 		 195 aa  158  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 		 200 aa  157  7e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 189 aa  157  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  42.47 
 
 		 191 aa  157  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  44.57 
 
 		 196 aa  155  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  41.34 
 
 		 183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  41.24 
 
 		 194 aa  151  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  40.21 
 
 		 194 aa  150  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  42.19 
 
 		 196 aa  150  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  42.19 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 199 aa  147  7e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  39.38 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  39.38 
 
 		 196 aa  140  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  39.8 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  38.66 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  39.8 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  39.7 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  37.88 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  38.78 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  39.49 
 
 		 202 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  37.76 
 
 		 202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  38.31 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  37.95 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  34.08 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 216 aa  85.1  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 173 aa  67  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5503  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5123  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5212  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5738  orotate phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3734  hypothetical protein  24.61 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0720  xanthine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000414905  normal  0.141539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2026  orotate phosphoribosyltransferase  28.65 
 
 		 245 aa  52.4  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000542739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0841  orotate phosphoribosyltransferase  28.82 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.637586 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3103  orotate phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 180 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2755  xanthine phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>