262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0912 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
194 aa  387  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  77.72 
 
 
196 aa  279  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  72.4 
 
 
196 aa  270  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  54.45 
 
 
194 aa  205  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  57.07 
 
 
194 aa  205  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  54.64 
 
 
196 aa  204  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  54.92 
 
 
196 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  52.88 
 
 
194 aa  196  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  53.65 
 
 
195 aa  194  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  51.28 
 
 
196 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
196 aa  188  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  51.81 
 
 
196 aa  188  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  54.64 
 
 
189 aa  187  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  46.94 
 
 
200 aa  184  7e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  48.96 
 
 
201 aa  184  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  50.27 
 
 
189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 
193 aa  178  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  47.15 
 
 
190 aa  177  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
191 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  45.55 
 
 
192 aa  170  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  49.21 
 
 
192 aa  168  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  49.21 
 
 
192 aa  168  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  43.39 
 
 
191 aa  167  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  45.74 
 
 
193 aa  164  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  47.28 
 
 
191 aa  164  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  43.62 
 
 
199 aa  161  7e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
187 aa  161  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
187 aa  161  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 
196 aa  160  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  41.54 
 
 
206 aa  160  1e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
195 aa  160  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  44.09 
 
 
192 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  44.09 
 
 
192 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  43.92 
 
 
198 aa  160  2e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
190 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  42.33 
 
 
188 aa  157  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
193 aa  157  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
195 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
191 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 
193 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  42.33 
 
 
188 aa  155  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  46.6 
 
 
189 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  45.21 
 
 
189 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
193 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  42.64 
 
 
202 aa  151  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 
191 aa  149  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  43.62 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  42.64 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 
202 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
196 aa  142  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  42.54 
 
 
195 aa  142  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
202 aa  142  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  43.1 
 
 
183 aa  140  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  39.09 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 
188 aa  137  7e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  38.58 
 
 
202 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 
199 aa  136  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 
202 aa  136  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 
202 aa  135  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 
202 aa  134  7.000000000000001e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  44.89 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 
202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  43.88 
 
 
196 aa  129  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  36 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
187 aa  125  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  36.57 
 
 
187 aa  122  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  33.71 
 
 
192 aa  99  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  25.44 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  32.3 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
179 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  25.15 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  26.79 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
178 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 
204 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 
179 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
169 aa  56.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  23.39 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
202 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  28.73 
 
 
178 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  28.82 
 
 
213 aa  54.7  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
194 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  23.98 
 
 
185 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  29.19 
 
 
191 aa  54.7  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3008  orotate phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  23.39 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>