218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3390 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
196 aa  381  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  96.94 
 
 
196 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  95.92 
 
 
196 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  78.24 
 
 
196 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  77.6 
 
 
196 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  62.18 
 
 
194 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  60.31 
 
 
194 aa  231  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  57.22 
 
 
194 aa  230  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  59.28 
 
 
192 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  59.28 
 
 
192 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  58.76 
 
 
192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  53.09 
 
 
192 aa  202  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
196 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  51.28 
 
 
194 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  50.26 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 
189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  46.32 
 
 
200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  43.81 
 
 
201 aa  162  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  41.88 
 
 
190 aa  158  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
190 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  44.62 
 
 
193 aa  156  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  41.54 
 
 
199 aa  154  8e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 
196 aa  150  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
198 aa  149  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
193 aa  149  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  38.74 
 
 
191 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  38.38 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  41.88 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
195 aa  145  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 
195 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  39.36 
 
 
192 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  39.36 
 
 
192 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  42.63 
 
 
187 aa  143  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  42.63 
 
 
187 aa  143  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  37.19 
 
 
206 aa  142  4e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  41.85 
 
 
199 aa  142  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  39.38 
 
 
193 aa  140  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  40.41 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
191 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  42.47 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 
195 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 
193 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  38.33 
 
 
190 aa  136  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 
189 aa  135  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 
187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
187 aa  134  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 
188 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  38.73 
 
 
183 aa  134  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  37.56 
 
 
195 aa  133  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  38.97 
 
 
188 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  39.25 
 
 
196 aa  132  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 
187 aa  131  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  38.81 
 
 
202 aa  127  8.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 
202 aa  127  9.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  38.97 
 
 
202 aa  122  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 
196 aa  122  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
202 aa  121  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
202 aa  121  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  38.27 
 
 
202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 
202 aa  107  9.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 
192 aa  89  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  26.14 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3471  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  31.45 
 
 
204 aa  55.1  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.743259  decreased coverage  0.000656001 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  24.36 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  23.72 
 
 
210 aa  54.7  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  25.88 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  28.23 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  23.72 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  23.72 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  23.72 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  23.72 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  23.72 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  23.72 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  23.72 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1895  orotate phosphoribosyltransferase  26.29 
 
 
214 aa  52.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  23.72 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  25 
 
 
209 aa  52  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
192 aa  51.6  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 
215 aa  50.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  24.56 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0080  orotate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0089  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  29.85 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 
207 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 
215 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0619  orotate phosphoribosyltransferase  26.88 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000147946 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0921  orotate phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 
230 aa  49.3  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>