222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2869 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  65.8 
 
 		 194 aa  253  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  65.46 
 
 		 194 aa  250  7e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  63.73 
 
 		 192 aa  245  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  63.73 
 
 		 192 aa  244  6.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  63.73 
 
 		 192 aa  244  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  60.31 
 
 		 196 aa  231  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  60.31 
 
 		 196 aa  230  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  59.49 
 
 		 196 aa  228  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  59.38 
 
 		 196 aa  224  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  58.76 
 
 		 196 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  56.99 
 
 		 192 aa  221  4e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  52.88 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  54.45 
 
 		 196 aa  187  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  52.31 
 
 		 196 aa  175  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  42.49 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  42.49 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 		 191 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  43.52 
 
 		 201 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  41.75 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 		 196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  40.21 
 
 		 193 aa  150  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  41.45 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  37.17 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  39.27 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  38.17 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  40.93 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 		 195 aa  144  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  40.31 
 
 		 196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  40.86 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  38.74 
 
 		 191 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  41.15 
 
 		 191 aa  141  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  38.17 
 
 		 191 aa  138  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  38.3 
 
 		 192 aa  138  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  38.3 
 
 		 192 aa  138  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  40.93 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  38.17 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 199 aa  134  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  38.17 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  37.77 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 		 187 aa  130  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  38.3 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  38.78 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  39.22 
 
 		 202 aa  121  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  38.73 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 202 aa  117  7.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  38.73 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  36.76 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 		 202 aa  111  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  34.22 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  29.89 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0528  orotate phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.560571  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  27.87 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  28.49 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  26.15 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  24.55 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  29.6 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  27.06 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  27.82 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  28.23 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0921  orotate phosphoribosyltransferase  26.54 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>