More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0017 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  81.28 
 
 		 188 aa  322  3e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  80.75 
 
 		 188 aa  321  6e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  78.72 
 
 		 193 aa  317  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  77.3 
 
 		 191 aa  301  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  72.25 
 
 		 193 aa  300  8.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  66.84 
 
 		 193 aa  271  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 		 191 aa  221  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  58.47 
 
 		 191 aa  217  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  52.75 
 
 		 191 aa  214  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  50.8 
 
 		 190 aa  211  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 193 aa  210  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  54.35 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  50.82 
 
 		 190 aa  204  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 		 193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  48.91 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  45.21 
 
 		 192 aa  184  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  45.21 
 
 		 192 aa  184  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 		 187 aa  184  8e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 		 187 aa  184  8e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  48.07 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  43.89 
 
 		 187 aa  174  9e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  42.19 
 
 		 195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  43.52 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  44.16 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  42.7 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  42.78 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  43.48 
 
 		 196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 		 195 aa  161  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  44.16 
 
 		 202 aa  158  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  43.62 
 
 		 194 aa  158  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  37.63 
 
 		 188 aa  154  7e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 		 202 aa  154  9e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  42.33 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  38.92 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  40.64 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  41.12 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  43.28 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 		 190 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  40.84 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 		 196 aa  148  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  38.17 
 
 		 194 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  39.49 
 
 		 206 aa  141  8e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  38.02 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  38.02 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  37.37 
 
 		 194 aa  134  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  36.98 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  34.54 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  29.48 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 173 aa  67  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3734  hypothetical protein  24.87 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1199  pyrE protein  30.34 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  25.68 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  25.14 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5503  orotate phosphoribosyltransferase  30.94 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5123  orotate phosphoribosyltransferase  30.94 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5212  orotate phosphoribosyltransferase  30.94 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  32.82 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  30.87 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  24.59 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0841  orotate phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.637586 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  24.59 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5738  orotate phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  29.19 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 		 177 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>