206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1509 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  88.12 
 
 		 202 aa  363  1e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  87.62 
 
 		 202 aa  362  2e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  87.13 
 
 		 202 aa  357  5e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  81.19 
 
 		 202 aa  334  3.9999999999999995e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  76.24 
 
 		 202 aa  322  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  76.24 
 
 		 202 aa  311  5.999999999999999e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  74.26 
 
 		 202 aa  305  2.0000000000000002e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  67.82 
 
 		 202 aa  282  2.0000000000000002e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  60.89 
 
 		 202 aa  254  6e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  46.5 
 
 		 189 aa  178  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  45.92 
 
 		 190 aa  168  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 		 191 aa  158  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  42.79 
 
 		 189 aa  158  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  43.65 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  40.31 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  43 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  38.19 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  38.19 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  40.91 
 
 		 191 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  43.84 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  39 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 		 189 aa  145  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 		 195 aa  145  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  38.78 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  37.88 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  37.37 
 
 		 191 aa  141  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  38.27 
 
 		 193 aa  140  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  39.5 
 
 		 191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  37.76 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 		 199 aa  131  6.999999999999999e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  37.69 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  37.13 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  38.66 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  37.75 
 
 		 196 aa  128  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  36.89 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  36.89 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  37 
 
 		 196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  37.76 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 		 195 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 		 194 aa  118  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 194 aa  117  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  36.46 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  31.77 
 
 		 183 aa  115  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  31.09 
 
 		 190 aa  111  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  31.66 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  27.72 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 		 173 aa  67.8  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1353  orotate phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  30.86 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  30.86 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  26.79 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  25.68 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  26.88 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  28.32 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  26.92 
 
 		 482 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  28.17 
 
 		 181 aa  54.7  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  26.57 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  26.18 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  27.61 
 
 		 500 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>