More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1108 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
172 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  55.21 
 
 
169 aa  180  8.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  54.88 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0841  orotate phosphoribosyltransferase  54.6 
 
 
167 aa  154  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.637586 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2360  orotate phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 
172 aa  152  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.166662 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  50.94 
 
 
187 aa  141  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  45.78 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  43.56 
 
 
179 aa  131  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  40.33 
 
 
185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  40.33 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  39.78 
 
 
185 aa  124  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  38.82 
 
 
185 aa  120  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
215 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
191 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0953  orotate phosphoribosyltransferase  39.05 
 
 
183 aa  105  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 
173 aa  105  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1641  orotate phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 
215 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 
191 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03551  orotate phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 
193 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 
190 aa  101  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  35.4 
 
 
176 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  40.52 
 
 
175 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
174 aa  99  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 
192 aa  99  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  33.13 
 
 
195 aa  97.4  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  37.58 
 
 
185 aa  97.4  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 
194 aa  96.7  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  37.5 
 
 
474 aa  96.7  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  29.56 
 
 
479 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
188 aa  94.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.78 
 
 
477 aa  95.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  29.56 
 
 
479 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  36.11 
 
 
500 aa  94.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
201 aa  94.4  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03021  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
194 aa  94  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.0000452779  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  35.59 
 
 
206 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 
201 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24961  orotate phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 
196 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  40.79 
 
 
204 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 
201 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  34.94 
 
 
187 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  37.72 
 
 
202 aa  91.7  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.79 
 
 
482 aa  90.9  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 
187 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  33.15 
 
 
191 aa  90.1  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  35.26 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 
219 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  32.45 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  33.13 
 
 
213 aa  89  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1476  orotate phosphoribosyltransferase  36 
 
 
234 aa  88.6  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19167  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
176 aa  88.6  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  35.95 
 
 
174 aa  88.2  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  38 
 
 
192 aa  88.2  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 
187 aa  87.8  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
198 aa  87.4  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
180 aa  87  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
208 aa  87  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 
192 aa  87  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  35.39 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0528  orotate phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 
230 aa  85.5  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  35.03 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4468  orotate phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 
223 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5738  orotate phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3147  orotate phosphoribosyltransferase  34.43 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  35.95 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  30.64 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.47 
 
 
451 aa  82.8  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5503  orotate phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5123  orotate phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5212  orotate phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0138  orotate phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79347  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0566  orotate phosphoribosyltransferase  34.08 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6936  orotate phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.824462  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1589  orotate phosphoribosyltransferase  35.54 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0107  orotate phosphoribosyltransferase  36.3 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3950  orotate phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0097  orotate phosphoribosyltransferase  34.23 
 
 
213 aa  80.5  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0812826  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03499  orotate phosphoribosyltransferase  34.9 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0295894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0063  orotate phosphoribosyltransferase  34.9 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3851  orotate phosphoribosyltransferase  34.9 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0069  orotate phosphoribosyltransferase  34.9 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000170079  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03451  hypothetical protein  34.9 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0214857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3416  orotate phosphoribosyltransferase  31.49 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0056  orotate phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  0.0416513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3977  orotate phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  34.71 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  30.73 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4013  orotate phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3932  orotate phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0874196  hitchhiker  0.000146436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>