187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1001 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1001  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1353  orotate phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2181  orotate phosphoribosyltransferase  43.87 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.134132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2888  orotate phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0334106  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  42.45 
 
 		 209 aa  163  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  40.67 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  40.28 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  43.48 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1264  orotate phosphoribosyltransferase  41.58 
 
 		 203 aa  154  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1289  orotate phosphoribosyltransferase  41.58 
 
 		 203 aa  154  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0771  orotate phosphoribosyltransferase  42.57 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 		 210 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  39.45 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  39.05 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  40.45 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 		 210 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 		 210 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.08 
 
 		 451 aa  148  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0402  orotate phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 		 210 aa  148  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 		 210 aa  148  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1785  orotate phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 		 215 aa  148  8e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0981  orotate phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1094  orotate phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 		 212 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1987  orotate phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 		 210 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0105796  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1721  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2507  orotate phosphoribosyltransferase  33.03 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0566  orotate phosphoribosyltransferase  33.02 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0138  orotate phosphoribosyltransferase  34.42 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0528  orotate phosphoribosyltransferase  41.21 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0057  orotate phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1317  orotate phosphoribosyltransferase  30.84 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1476  orotate phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19167  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0056  orotate phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  0.0416513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2871  orotate phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.959214  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3789  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.360033  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0107  orotate phosphoribosyltransferase  38.06 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2587  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2372  orotate phosphoribosyltransferase  32 
 
 		 226 aa  95.1  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0020  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3125  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3531  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1968  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.174064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3851  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3522  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.571164  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0134  orotate phosphoribosyltransferase  39.35 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4468  orotate phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1741  orotate phosphoribosyltransferase  30.73 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0662938  normal  0.536983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5320  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3111  orotate phosphoribosyltransferase  36.6 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 		 193 aa  92.8  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0324  orotate phosphoribosyltransferase  33.74 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0219  orotate phosphoribosyltransferase  35.95 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744558  hitchhiker  0.000000000190609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0281  orotate phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 		 228 aa  91.7  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3676  orotate phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 		 228 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0607771  hitchhiker  0.0000000000680378 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1929  orotate phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0236  orotate phosphoribosyltransferase  35.95 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0580  orotate phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0244  orotate phosphoribosyltransferase  35.95 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1777  orotate phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693313  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  40.8 
 
 		 192 aa  89.4  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2789  orotate phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0317  orotate phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0297  orotate phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108566 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3416  orotate phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2045  orotate phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1589  orotate phosphoribosyltransferase  41.61 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  36 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  28.96 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  32.35 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  33.87 
 
 		 173 aa  64.7  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 		 181 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  30.15 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  28.8 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  29.65 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  28.69 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>