More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0547 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0547  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3471  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  81.86 
 
 		 204 aa  329  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.743259  decreased coverage  0.000656001 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1806  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  57.77 
 
 		 203 aa  240  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0089  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  51.96 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2583  phosphoribosyltransferase  42.06 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2261  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  41.98 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0519341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0705  phosphoribosyltransferase  40.36 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2276  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  40.87 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2394  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  43.35 
 
 		 201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.421061 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0798  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  41.51 
 
 		 211 aa  164  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0772  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  42.86 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00698153  hitchhiker  0.000000112154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0272  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  41.83 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.205067  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4086  phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.288574  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0973  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  42.86 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.405367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1417  phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2698  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  39.34 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1091  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  34.13 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1599  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  36.27 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0870  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  36.27 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.200456  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1077  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  36.76 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1299  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  34.5 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  37.39 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  36.45 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  37.23 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  35.94 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  31.19 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  38.68 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  29.5 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2034  orotate phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0234  orotate phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  37.89 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0228  orotate phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  34.19 
 
 		 170 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0035  orotate phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  37.63 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0041  orotate phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.23 
 
 		 316 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.23 
 
 		 316 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0340  orotate phosphoribosyltransferase  32.23 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  30.21 
 
 		 171 aa  51.6  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0139  orotate phosphoribosyltransferase  37.86 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.17 
 
 		 316 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0686  orotate phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1625  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.5 
 
 		 321 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.765759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1618  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  42.19 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0088  orotate phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0150  orotate phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.5 
 
 		 321 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0289  orotate phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0195  orotate phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  35.87 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1895  orotate phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.17 
 
 		 320 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0168  orotate phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0122  orotate phosphoribosyltransferase  27.94 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  41.27 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 		 168 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.95 
 
 		 311 aa  48.9  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  27.66 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  27.66 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 171 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3928  orotate phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 319 aa  48.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1753  orotate phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  29.1 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  30.09 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>