45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2698 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2698  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 
206 aa  423  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2394  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  65.87 
 
 
201 aa  275  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.421061 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0973  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  60.19 
 
 
202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.405367  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0772  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  60.87 
 
 
198 aa  246  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00698153  hitchhiker  0.000000112154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0272  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  56.04 
 
 
204 aa  237  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.205067  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0089  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  42.38 
 
 
205 aa  157  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0547  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  39.34 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1806  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  39.05 
 
 
203 aa  145  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3471  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  40.28 
 
 
204 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.743259  decreased coverage  0.000656001 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2261  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.16 
 
 
212 aa  135  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0519341  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2583  phosphoribosyltransferase  35.45 
 
 
216 aa  134  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0705  phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 
225 aa  131  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0798  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  36.07 
 
 
211 aa  127  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4086  phosphoribosyltransferase  35.98 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.288574  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2276  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  34.88 
 
 
205 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1091  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  34.72 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1417  phosphoribosyltransferase  34.5 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1299  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  32.08 
 
 
206 aa  106  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1599  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.64 
 
 
205 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0870  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.64 
 
 
205 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.200456  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1077  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.18 
 
 
205 aa  104  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
193 aa  52  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0216  orotate phosphoribosyltransferase  25.82 
 
 
213 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  28.33 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0080  orotate phosphoribosyltransferase  25.82 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0017  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  36.44 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 
187 aa  45.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  26.83 
 
 
219 aa  45.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  26.83 
 
 
219 aa  45.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 
187 aa  45.8  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3708  orotate phosphoribosyltransferase  27.38 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  30 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  25.86 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  27.75 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  26.28 
 
 
185 aa  42.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0216  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1895  orotate phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
196 aa  42.7  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  24.03 
 
 
178 aa  42.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3634  orotate phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
189 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.274017  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  27.35 
 
 
192 aa  42.4  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3568  orotate phosphoribosyltransferase  23.81 
 
 
189 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0180203  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  28 
 
 
233 aa  41.6  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0619  orotate phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 
215 aa  41.6  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000147946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>