124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0772 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0772  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 
198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00698153  hitchhiker  0.000000112154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2394  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  59.7 
 
 
201 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.421061 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2698  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  60.87 
 
 
206 aa  246  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0272  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  56.37 
 
 
204 aa  230  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.205067  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0973  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  54.77 
 
 
202 aa  228  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.405367  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3471  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  43.96 
 
 
204 aa  166  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.743259  decreased coverage  0.000656001 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0089  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  41.87 
 
 
205 aa  162  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0547  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  42.86 
 
 
202 aa  156  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1806  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  40.2 
 
 
203 aa  148  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2261  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  36.02 
 
 
212 aa  143  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0519341  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2583  phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 
216 aa  141  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2276  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  39.13 
 
 
205 aa  137  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0705  phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
225 aa  136  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0798  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.55 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4086  phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 
209 aa  125  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.288574  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1417  phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
194 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1599  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  36.84 
 
 
205 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1091  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.89 
 
 
205 aa  115  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1077  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  37.32 
 
 
205 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0870  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  36.84 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.200456  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1299  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  30.85 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  27.87 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0122  orotate phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  28.8 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0255  orotate phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
212 aa  48.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0225  orotate phosphoribosyltransferase  25.27 
 
 
228 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.195509  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2485  orotate phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0168  orotate phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
237 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0139  orotate phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 
221 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0278  orotate phosphoribosyltransferase  32.79 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0686  orotate phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0320  orotate phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
213 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  25.15 
 
 
175 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0041  orotate phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
225 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 
233 aa  45.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0035  orotate phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
225 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4013  orotate phosphoribosyltransferase  27.75 
 
 
213 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4059  orotate phosphoribosyltransferase  27.75 
 
 
213 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3932  orotate phosphoribosyltransferase  27.75 
 
 
213 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0874196  hitchhiker  0.000146436 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4120  orotate phosphoribosyltransferase  27.75 
 
 
213 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2501  pur operon repressor  25 
 
 
267 aa  45.1  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  22.6 
 
 
178 aa  44.7  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0088  orotate phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
234 aa  44.7  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0080  orotate phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 
213 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  27.63 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0216  orotate phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 
213 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2507  orotate phosphoribosyltransferase  31.87 
 
 
227 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0619  orotate phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000147946 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1212  phosphoribosyltransferase  26.39 
 
 
246 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.279163  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  23.97 
 
 
282 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0228  orotate phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
236 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  29.67 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1895  orotate phosphoribosyltransferase  24.49 
 
 
214 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2815  pur operon repressor  24.26 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3478  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.972793  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  26.76 
 
 
195 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0023  phosphoribosyltransferase  23.81 
 
 
235 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00393898 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  29.36 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0340  orotate phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0071  orotate phosphoribosyltransferase  29.5 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3950  orotate phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 
213 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  26.61 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  23.97 
 
 
282 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2026  orotate phosphoribosyltransferase  27.64 
 
 
245 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000542739  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1102  phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 
250 aa  43.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.594083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0234  orotate phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960062  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1618  orotate phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 
232 aa  42.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  23.97 
 
 
282 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  26.79 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  26.72 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03499  orotate phosphoribosyltransferase  24.85 
 
 
213 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0295894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0063  orotate phosphoribosyltransferase  24.85 
 
 
213 aa  42.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4105  orotate phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00891654  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  26.19 
 
 
182 aa  42.4  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
187 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4394  orotate phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 
213 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000864609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03451  hypothetical protein  24.85 
 
 
213 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0214857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0041  pur operon repressor  23.97 
 
 
282 aa  42.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3851  orotate phosphoribosyltransferase  24.85 
 
 
213 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0069  orotate phosphoribosyltransferase  24.85 
 
 
213 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000170079  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3977  orotate phosphoribosyltransferase  24.85 
 
 
213 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4049  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
231 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000386035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  23.97 
 
 
282 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  23.97 
 
 
282 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  23.97 
 
 
282 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  23.97 
 
 
282 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0517  pur operon repressor  30.43 
 
 
274 aa  42  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00109684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0530  pur operon repressor  30.43 
 
 
274 aa  42  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  23.97 
 
 
282 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  23.97 
 
 
282 aa  42  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>