154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2394 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2394  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.421061 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2698  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  65.87 
 
 
206 aa  275  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0973  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  65.17 
 
 
202 aa  262  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.405367  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0772  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  59.7 
 
 
198 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00698153  hitchhiker  0.000000112154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0272  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  56.86 
 
 
204 aa  240  9e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.205067  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0089  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  45.1 
 
 
205 aa  167  8e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0547  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  43.35 
 
 
202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3471  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  43.41 
 
 
204 aa  156  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.743259  decreased coverage  0.000656001 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2276  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  38.76 
 
 
205 aa  142  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1806  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  39.42 
 
 
203 aa  140  9e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2583  phosphoribosyltransferase  35.05 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0798  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  38.03 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2261  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  36.36 
 
 
212 aa  138  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0519341  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0705  phosphoribosyltransferase  34.98 
 
 
225 aa  137  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4086  phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.288574  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1417  phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1091  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  34.3 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1599  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
205 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0870  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
205 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.200456  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1077  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  32.85 
 
 
205 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1299  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  31.71 
 
 
206 aa  102  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2007  orotate phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 
222 aa  62  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0225  orotate phosphoribosyltransferase  30.87 
 
 
228 aa  58.5  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.195509  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  33.63 
 
 
233 aa  58.2  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  35 
 
 
193 aa  58.2  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0278  orotate phosphoribosyltransferase  31.5 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0619  orotate phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000147946 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001826  orotate phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  30.09 
 
 
219 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 
219 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  30.09 
 
 
219 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0071  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
211 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0122  orotate phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
213 aa  55.1  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00649  orotate phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 
224 aa  54.7  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0340  orotate phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 
231 aa  55.1  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2026  orotate phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
245 aa  54.7  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000542739  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2740  orotate phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 
219 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0088  orotate phosphoribosyltransferase  26.14 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0154  orotate phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4120  orotate phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0216  orotate phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4013  orotate phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2485  orotate phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3932  orotate phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0874196  hitchhiker  0.000146436 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4059  orotate phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4394  orotate phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000864609  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4143  orotate phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00122436  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3977  orotate phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0080  orotate phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5012  orotate phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.127395  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1895  orotate phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
214 aa  52.8  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0321  orotate phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1618  orotate phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
232 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4105  orotate phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00891654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4067  orotate phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00621989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03499  orotate phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0295894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0063  orotate phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160441  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3204  orotate phosphoribosyltransferase  38 
 
 
234 aa  52.4  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4049  orotate phosphoribosyltransferase  29.6 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000386035 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0168  orotate phosphoribosyltransferase  30 
 
 
237 aa  52.4  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3851  orotate phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03451  hypothetical protein  30.47 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0214857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0069  orotate phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000170079  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  29.36 
 
 
201 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3964  orotate phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
213 aa  51.6  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0234  orotate phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
236 aa  51.6  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960062  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0057  orotate phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
215 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0177997  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0051  orotate phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
215 aa  51.6  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4159  orotate phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
215 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.041732  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3950  orotate phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 
213 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0228  orotate phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
236 aa  51.6  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0113  orotate phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05884  orotate phosphoribosyltransferase (Eurofung)  30.48 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0139  orotate phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 
237 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02880  orotate phosphoribosyltransferase  33.87 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4383  orotate phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101877 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0206  orotate phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3672  orotate phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.145212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0041  orotate phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0686  orotate phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0289  orotate phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 
239 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3487  orotate phosphoribosyltransferase  29.57 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0097  orotate phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0812826  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 
187 aa  50.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0035  orotate phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 
187 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0255  orotate phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2590  orotate phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
214 aa  49.3  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.431923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3928  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
223 aa  48.9  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0379  orotate phosphoribosyltransferase  29.57 
 
 
213 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3603  orotate phosphoribosyltransferase  29.57 
 
 
215 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3776  orotate phosphoribosyltransferase  29.57 
 
 
215 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.851332 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
189 aa  48.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0396  orotate phosphoribosyltransferase  29.57 
 
 
213 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  30.47 
 
 
513 aa  48.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>