109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0272 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0272  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.205067  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2394  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  56.86 
 
 		 201 aa  240  9e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.421061 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2698  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  56.04 
 
 		 206 aa  237  9e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0772  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  56.37 
 
 		 198 aa  230  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00698153  hitchhiker  0.000000112154 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0973  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  55.67 
 
 		 202 aa  229  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.405367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0089  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  40.48 
 
 		 205 aa  155  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0547  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  41.83 
 
 		 202 aa  151  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3471  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  41.83 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.743259  decreased coverage  0.000656001 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2583  phosphoribosyltransferase  37.39 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2276  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  39.15 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0705  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0798  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  37.04 
 
 		 211 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2261  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  37.16 
 
 		 212 aa  134  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0519341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1806  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  38.16 
 
 		 203 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4086  phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.288574  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1417  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1091  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  34.95 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1599  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.5 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1077  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.98 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0870  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.5 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.200456  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1299  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  32.2 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0168  orotate phosphoribosyltransferase  37.07 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0234  orotate phosphoribosyltransferase  36.56 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0340  orotate phosphoribosyltransferase  37.63 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0228  orotate phosphoribosyltransferase  36.56 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  32.63 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0071  orotate phosphoribosyltransferase  38 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0289  orotate phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  35.42 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4049  orotate phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000386035 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0225  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.195509  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_4059  predicted protein  38.46 
 
 		 312 aa  49.7  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0278  orotate phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0139  orotate phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0122  orotate phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1618  orotate phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4013  orotate phosphoribosyltransferase  33.98 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4059  orotate phosphoribosyltransferase  33.98 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3932  orotate phosphoribosyltransferase  33.98 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0874196  hitchhiker  0.000146436 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4120  orotate phosphoribosyltransferase  33.98 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0088  orotate phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0619  orotate phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000147946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0041  orotate phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3950  orotate phosphoribosyltransferase  33.98 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0035  orotate phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2026  orotate phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000542739  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4143  orotate phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00122436  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3977  orotate phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03499  orotate phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0295894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0063  orotate phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160441  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  30.11 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  32.63 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3851  orotate phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0069  orotate phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000170079  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4067  orotate phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00621989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5012  orotate phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.127395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03451  hypothetical protein  33.01 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0214857  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3928  orotate phosphoribosyltransferase  33.88 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0255  orotate phosphoribosyltransferase  34.41 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2740  orotate phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4281  orotate phosphoribosyltransferase  35.42 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4105  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00891654  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  34.92 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1646  amidophosphoribosyltransferase  29.91 
 
 		 499 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1639  amidophosphoribosyltransferase  29.91 
 
 		 499 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0217  orotate phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2007  orotate phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0057  orotate phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0177997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  31.31 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0051  orotate phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4159  orotate phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.041732  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1724  orotate phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.286462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  24.31 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0097  orotate phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0812826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0686  orotate phosphoribosyltransferase  30.39 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  30.39 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  31.3 
 
 		 470 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0113  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2530  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4394  orotate phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000864609  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1695  Amidophosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 401 aa  42.4  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3732  orotate phosphoribosyltransferase  30.11 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.660148 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  32.22 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>