286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1806 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1806  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 
203 aa  412  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3471  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  65.69 
 
 
204 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.743259  decreased coverage  0.000656001 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0547  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  57.77 
 
 
202 aa  240  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0089  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  45.59 
 
 
205 aa  190  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1417  phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 
194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2276  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  38.57 
 
 
205 aa  159  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2583  phosphoribosyltransferase  39.17 
 
 
216 aa  154  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2261  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  38.5 
 
 
212 aa  154  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0519341  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0798  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  39.44 
 
 
211 aa  151  8e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0705  phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 
225 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0772  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  40.2 
 
 
198 aa  148  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00698153  hitchhiker  0.000000112154 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4086  phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.288574  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2698  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  39.05 
 
 
206 aa  145  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2394  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  39.42 
 
 
201 aa  140  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.421061 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0272  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  38.16 
 
 
204 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.205067  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0973  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  36.89 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.405367  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1091  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.07 
 
 
205 aa  116  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1077  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.71 
 
 
205 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1599  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.24 
 
 
205 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0870  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.24 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.200456  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1299  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  29.47 
 
 
206 aa  92.4  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
189 aa  62  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 
191 aa  58.2  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  30.39 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  29.6 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  29.6 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  27.61 
 
 
175 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 
187 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1053  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
207 aa  51.6  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.295843  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1264  orotate phosphoribosyltransferase  25.6 
 
 
203 aa  51.2  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1289  orotate phosphoribosyltransferase  25.6 
 
 
203 aa  51.2  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1625  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.32 
 
 
321 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.765759  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  30 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0071  orotate phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0645  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.66 
 
 
310 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.32 
 
 
321 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.85 
 
 
316 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  25.2 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  26.19 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1302  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
226 aa  49.3  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal  0.0146938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.73 
 
 
310 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2034  orotate phosphoribosyltransferase  25.17 
 
 
234 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  29.84 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
193 aa  49.3  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0771  orotate phosphoribosyltransferase  25.34 
 
 
203 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.05 
 
 
346 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
183 aa  48.9  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.57 
 
 
310 aa  48.5  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.05 
 
 
314 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.87 
 
 
313 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
192 aa  48.5  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.73 
 
 
310 aa  48.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1736  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
182 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.52 
 
 
311 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0789  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.88 
 
 
326 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  28.78 
 
 
219 aa  48.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0139  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
237 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1707  Uracil phosphoribosyltransferase  27.45 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  26.61 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.05 
 
 
314 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
193 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  24.3 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.47 
 
 
321 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000509786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  30.93 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  29 
 
 
221 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0035  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
225 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0041  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
225 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.83 
 
 
310 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  28.57 
 
 
513 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  29.31 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  27.64 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0168  orotate phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 
237 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.05 
 
 
313 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.71 
 
 
282 aa  46.6  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.05 
 
 
313 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1753  orotate phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1351  Uracil phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00861073 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.72 
 
 
316 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.62 
 
 
310 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.72 
 
 
316 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  26.72 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  25.78 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  29.7 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.45 
 
 
321 aa  45.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.63 
 
 
314 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1747  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.41 
 
 
285 aa  45.8  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.400823  normal  0.232967 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0234  orotate phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960062  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  27.94 
 
 
212 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>