More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0204 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.91 
 
 
282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0167  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.11 
 
 
293 aa  210  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00051892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.11 
 
 
283 aa  208  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.49 
 
 
287 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.4 
 
 
282 aa  205  8e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.231017  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.78 
 
 
287 aa  202  4e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.14 
 
 
281 aa  202  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.78 
 
 
287 aa  202  7e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.72 
 
 
287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0775  hypothetical protein  39.44 
 
 
281 aa  189  4e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000000110897  hitchhiker  0.00000000000484536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.38 
 
 
281 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0275  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.55 
 
 
285 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000000178849  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.19 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0660085  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0087  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.46 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1774  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.03 
 
 
292 aa  171  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.11 
 
 
314 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.93 
 
 
291 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.35 
 
 
315 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0317  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.36 
 
 
276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.300322  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0975  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.52 
 
 
279 aa  165  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221596  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.08 
 
 
308 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.98129  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.65 
 
 
322 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.71 
 
 
317 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.31 
 
 
313 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2178  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.4 
 
 
284 aa  162  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.115162  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.11 
 
 
313 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33 
 
 
315 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.89 
 
 
315 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.47 
 
 
330 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.11 
 
 
310 aa  158  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.44 
 
 
323 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.78 
 
 
314 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  33.22 
 
 
319 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.89 
 
 
329 aa  157  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  34.56 
 
 
321 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.56 
 
 
321 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.67 
 
 
331 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.88 
 
 
324 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.45 
 
 
311 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.22 
 
 
314 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.613362  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.35 
 
 
322 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33 
 
 
317 aa  156  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  32.88 
 
 
317 aa  156  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.05 
 
 
309 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.05 
 
 
309 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.12 
 
 
317 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.12 
 
 
317 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.12 
 
 
317 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.12 
 
 
317 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.12 
 
 
317 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.12 
 
 
317 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.12 
 
 
317 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.12 
 
 
317 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.12 
 
 
317 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  32.78 
 
 
321 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.56 
 
 
318 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.56 
 
 
318 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.05 
 
 
309 aa  155  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.22 
 
 
315 aa  155  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.78 
 
 
332 aa  155  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.23 
 
 
330 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.78 
 
 
314 aa  155  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.77 
 
 
313 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.77 
 
 
310 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.78 
 
 
317 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.4 
 
 
310 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.37 
 
 
312 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.77 
 
 
310 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.88 
 
 
319 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.44 
 
 
313 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.44 
 
 
313 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.77 
 
 
310 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.76 
 
 
316 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1127  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.88 
 
 
297 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.22 
 
 
338 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.32 
 
 
318 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.25 
 
 
317 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.14 
 
 
311 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.74 
 
 
317 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0380  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.63 
 
 
285 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.447265  normal  0.0607873 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.75 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.41 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.76 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.54 
 
 
324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.77 
 
 
313 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.42 
 
 
310 aa  152  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.2 
 
 
316 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.42 
 
 
310 aa  152  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.11 
 
 
324 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.02 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.31 
 
 
311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2735  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.42 
 
 
308 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.44 
 
 
313 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.88 
 
 
338 aa  152  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1625  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.89 
 
 
321 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.765759  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.22 
 
 
321 aa  151  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.86 
 
 
316 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.86 
 
 
316 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.68 
 
 
317 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>