More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0363 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.26 
 
 
282 aa  404  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.06 
 
 
282 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.231017  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.17 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0775  hypothetical protein  48.76 
 
 
281 aa  264  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000000110897  hitchhiker  0.00000000000484536 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0275  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.31 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000000178849  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.29 
 
 
281 aa  241  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0975  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.79 
 
 
279 aa  239  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221596  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0087  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.2 
 
 
284 aa  225  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.91 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.91 
 
 
287 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.56 
 
 
287 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0167  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.31 
 
 
293 aa  218  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00051892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.45 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.75 
 
 
287 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.11 
 
 
282 aa  208  8e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2178  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.26 
 
 
284 aa  199  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.115162  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.58 
 
 
282 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.683749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0834  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.92 
 
 
280 aa  185  7e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.86 
 
 
314 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1774  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.15 
 
 
292 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1544  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.87 
 
 
279 aa  169  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.93 
 
 
309 aa  169  7e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.22 
 
 
309 aa  163  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.45 
 
 
329 aa  161  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.01 
 
 
313 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.65 
 
 
314 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
308 aa  159  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.1 
 
 
290 aa  159  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.53 
 
 
309 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.65 
 
 
315 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.31 
 
 
322 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.37 
 
 
331 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30170  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.68 
 
 
327 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.35865  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.02 
 
 
327 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.85 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.14 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.67 
 
 
317 aa  153  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.58 
 
 
316 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  32.09 
 
 
327 aa  152  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.22 
 
 
309 aa  152  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0987  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.68 
 
 
326 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257813 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.22 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.27 
 
 
312 aa  151  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.22 
 
 
309 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2923  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.05 
 
 
313 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0317  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.67 
 
 
276 aa  151  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.300322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.63 
 
 
315 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4249  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.11 
 
 
326 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.29 
 
 
316 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4335  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.11 
 
 
326 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.29 
 
 
316 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4628  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.11 
 
 
326 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.38327  normal  0.568111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0673  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.56 
 
 
314 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000671501  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1545  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.45 
 
 
325 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.317921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.56 
 
 
325 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.65 
 
 
322 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.95 
 
 
315 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.77 
 
 
326 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1288  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.67 
 
 
326 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.67 
 
 
312 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.67 
 
 
314 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
312 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0881  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.01 
 
 
327 aa  148  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.328682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.19 
 
 
316 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.95 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.61 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.45 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.44 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3195  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.11 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.42 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.01 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.88 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.97 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1290  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.22 
 
 
326 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.63 
 
 
318 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.67 
 
 
322 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.67 
 
 
324 aa  146  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.24 
 
 
326 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.77 
 
 
315 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11035  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.89 
 
 
326 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  33.67 
 
 
325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.88 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.98129  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4145  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.44 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0778  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.22 
 
 
332 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.69 
 
 
326 aa  146  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.45 
 
 
326 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.56 
 
 
325 aa  145  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.74 
 
 
309 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.53 
 
 
316 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.97 
 
 
322 aa  145  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.21 
 
 
311 aa  145  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1964  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.58 
 
 
314 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1175  ribose-phosphate diphosphokinase  31.23 
 
 
337 aa  144  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.27 
 
 
317 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0769  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.67 
 
 
324 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.88 
 
 
314 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.27 
 
 
317 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.72 
 
 
315 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049338  normal  0.157535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1357  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.72 
 
 
315 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000430302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>