More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2392 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
281 aa  564  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.14 
 
 
281 aa  358  5e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0275  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.5 
 
 
285 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000000178849  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0775  hypothetical protein  56.23 
 
 
281 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000000110897  hitchhiker  0.00000000000484536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0975  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.43 
 
 
279 aa  316  3e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221596  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.17 
 
 
283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.83 
 
 
282 aa  240  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.35 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.231017  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.14 
 
 
282 aa  202  5e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.31 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.61 
 
 
287 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.31 
 
 
287 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0167  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.34 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00051892  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.77 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0087  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.13 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.15 
 
 
291 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2178  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.22 
 
 
284 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.115162  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.47 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.683749 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1774  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.45 
 
 
292 aa  159  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0317  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.08 
 
 
276 aa  155  7e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.300322  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0834  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.8 
 
 
280 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.41 
 
 
286 aa  150  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0430198 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1544  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.23 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.79 
 
 
290 aa  146  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.19 
 
 
294 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0660085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.22 
 
 
315 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.43 
 
 
313 aa  142  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.11 
 
 
315 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.22 
 
 
315 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.48 
 
 
313 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.39 
 
 
316 aa  135  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.09 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.62 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.62 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.62 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.62 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.62 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.62 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.62 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.74 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.62 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.6 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.62 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.62 
 
 
317 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.31 
 
 
309 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.97 
 
 
331 aa  132  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.95 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.89 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  31.41 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.97 
 
 
309 aa  130  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.11 
 
 
317 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.25 
 
 
314 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.09 
 
 
317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.36 
 
 
325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.88 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.97 
 
 
309 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.12 
 
 
310 aa  128  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.45 
 
 
310 aa  128  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.23 
 
 
317 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.28 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.48 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.48 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.85 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.85 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.37 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.23 
 
 
309 aa  126  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.73 
 
 
314 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  31 
 
 
317 aa  126  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.6 
 
 
309 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.2 
 
 
331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.9 
 
 
331 aa  126  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.6 
 
 
309 aa  125  6e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.09 
 
 
314 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.29 
 
 
309 aa  125  9e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.27 
 
 
324 aa  125  9e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.3 
 
 
314 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.77 
 
 
308 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.25 
 
 
311 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.91 
 
 
317 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.94 
 
 
329 aa  124  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.69 
 
 
325 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.02 
 
 
317 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0764  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.19 
 
 
361 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0778  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.97 
 
 
332 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.97 
 
 
340 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0702588  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.85 
 
 
308 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.98129  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30 
 
 
315 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.33 
 
 
316 aa  122  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.36 
 
 
310 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.85 
 
 
346 aa  122  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.85 
 
 
314 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.33 
 
 
316 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.85 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.55 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.64 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.64 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.64 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  27.64 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.96 
 
 
316 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.75 
 
 
310 aa  120  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0838998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>