More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2016 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0660085  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.08 
 
 
290 aa  365  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.35 
 
 
286 aa  194  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0430198 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0317  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.98 
 
 
276 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.300322  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0167  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.14 
 
 
293 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00051892  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.9 
 
 
287 aa  185  8e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.16 
 
 
287 aa  183  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.53 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.53 
 
 
287 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.43 
 
 
282 aa  179  4e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0380  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.92 
 
 
285 aa  171  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.447265  normal  0.0607873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1127  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.69 
 
 
297 aa  170  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1347  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.8 
 
 
284 aa  169  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0988459 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1774  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.75 
 
 
292 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.64 
 
 
310 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.27 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.48 
 
 
314 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1747  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.1 
 
 
285 aa  161  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.400823  normal  0.232967 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.64 
 
 
310 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32 
 
 
310 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.75 
 
 
314 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.64 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.5 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.5 
 
 
346 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.64 
 
 
328 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.39 
 
 
316 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.5 
 
 
314 aa  155  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.32 
 
 
314 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.8 
 
 
310 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.91 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.8 
 
 
310 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.99 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.231017  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.09 
 
 
283 aa  152  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.39 
 
 
313 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.81 
 
 
317 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.83 
 
 
317 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384244  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.49 
 
 
317 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.49 
 
 
331 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.72 
 
 
282 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.32 
 
 
317 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.18 
 
 
310 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.18 
 
 
310 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.32 
 
 
331 aa  149  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.71 
 
 
317 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.5 
 
 
316 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.71 
 
 
317 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.33 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.77 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.33 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.33 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.33 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.33 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.33 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.33 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.33 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.01 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.33 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.91 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0838998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.33 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.77 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.77 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.03 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30 
 
 
318 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.04 
 
 
317 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
317 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.82 
 
 
319 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.11 
 
 
317 aa  145  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.36 
 
 
330 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.21 
 
 
331 aa  145  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.26 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.98 
 
 
311 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.5 
 
 
313 aa  145  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.82 
 
 
338 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  29.96 
 
 
312 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.35 
 
 
359 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.56 
 
 
340 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.25 
 
 
311 aa  145  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.66 
 
 
281 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.6 
 
 
338 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.85 
 
 
309 aa  144  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0971  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.16 
 
 
311 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0975  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.66 
 
 
279 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221596  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.27 
 
 
319 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32 
 
 
309 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.18 
 
 
318 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.52 
 
 
314 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.69 
 
 
330 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0645  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.03 
 
 
310 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2178  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32 
 
 
284 aa  143  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.115162  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.57 
 
 
311 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.18 
 
 
318 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.16 
 
 
318 aa  142  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.51 
 
 
308 aa  142  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.39 
 
 
309 aa  142  9e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.18 
 
 
320 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.08 
 
 
281 aa  142  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.82 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.82 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  32.32 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.82 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>