More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1270 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 		 309 aa  620  1e-177  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  88.35 
 
 		 309 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  88.35 
 
 		 309 aa  562  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  88.03 
 
 		 309 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  81.55 
 
 		 309 aa  533  1e-150  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.9 
 
 		 309 aa  512  1e-144  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.92 
 
 		 309 aa  513  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.96 
 
 		 309 aa  508  1e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.81 
 
 		 311 aa  509  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.7 
 
 		 308 aa  476  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.65 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.28 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.28 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.28 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.28 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.39 
 
 		 316 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.33 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.33 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.69 
 
 		 313 aa  377  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.63 
 
 		 310 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.69 
 
 		 313 aa  377  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.61 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.31 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00928462  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.28 
 
 		 314 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 324 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.06 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.06 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.26 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 		 332 aa  371  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.65 
 
 		 320 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 		 313 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.73 
 
 		 313 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.73 
 
 		 313 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.28 
 
 		 323 aa  371  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 		 316 aa  371  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.28 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0172  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093989 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.9 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.44 
 
 		 336 aa  368  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.47 
 
 		 319 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.22 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.98129  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 		 316 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0283  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.22 
 
 		 318 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 		 320 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1625  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.22 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.765759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.77 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.51 
 
 		 314 aa  364  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.36 
 
 		 314 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 		 316 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 		 317 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 319 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.84 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 		 321 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.77 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0289  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  57.1 
 
 		 321 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 		 314 aa  364  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3730  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.12 
 
 		 316 aa  364  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.322716 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.77 
 
 		 320 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.77 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.77 
 
 		 320 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.77 
 
 		 318 aa  363  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.77 
 
 		 320 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  57.05 
 
 		 312 aa  363  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.7 
 
 		 317 aa  363  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.14 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.95 
 
 		 315 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.17 
 
 		 316 aa  363  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0421  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.34 
 
 		 314 aa  363  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 		 315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 		 315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57 
 
 		 315 aa  361  9e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57 
 
 		 315 aa  361  9e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 		 324 aa  361  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.68 
 
 		 316 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.51 
 
 		 316 aa  360  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.63 
 
 		 314 aa  361  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.27 
 
 		 315 aa  360  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 		 315 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.51 
 
 		 315 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.51 
 
 		 315 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.51 
 
 		 315 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3463  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 		 315 aa  359  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281933  normal  0.770216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.51 
 
 		 315 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>