More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0100 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 		 316 aa  641    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  80 
 
 		 315 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.6 
 
 		 318 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.6 
 
 		 313 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.7 
 
 		 317 aa  473  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.43 
 
 		 322 aa  460  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.71 
 
 		 325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  64.44 
 
 		 317 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.38 
 
 		 322 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.39 
 
 		 314 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.71 
 
 		 316 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.13 
 
 		 315 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.78 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.78 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.78 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.78 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.78 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.78 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.78 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.42 
 
 		 317 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.78 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.13 
 
 		 315 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.78 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.78 
 
 		 317 aa  421  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.27 
 
 		 314 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.23 
 
 		 329 aa  410  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.15 
 
 		 319 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.31 
 
 		 319 aa  401  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.99 
 
 		 319 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.94 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  59.81 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.68 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.86 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  57.51 
 
 		 326 aa  383  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.32 
 
 		 318 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.33 
 
 		 314 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.64 
 
 		 338 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.32 
 
 		 318 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.39 
 
 		 312 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.97 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.74 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0138  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.29 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.056526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 312 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.97 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.05 
 
 		 338 aa  374  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.11 
 
 		 314 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.06 
 
 		 315 aa  375  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.87 
 
 		 315 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.11 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.71 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.69 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0522  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.26 
 
 		 321 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00402651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.75 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0535  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.26 
 
 		 321 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0143488  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.73 
 
 		 330 aa  371  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 312 aa  368  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.39 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2630  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.25 
 
 		 320 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  58.58 
 
 		 312 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 		 331 aa  366  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.38 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.03 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.29 
 
 		 323 aa  363  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.38 
 
 		 315 aa  364  1e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 		 321 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 		 312 aa  363  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 		 313 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.05 
 
 		 321 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 321 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.68 
 
 		 309 aa  361  1e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 		 316 aa  360  2e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0839  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.29 
 
 		 317 aa  359  3e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 		 331 aa  358  6e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.11 
 
 		 319 aa  358  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.28 
 
 		 317 aa  358  8e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.17 
 
 		 324 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0018  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 		 322 aa  355  3.9999999999999996e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00325732  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  57.23 
 
 		 321 aa  355  5e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.66 
 
 		 318 aa  355  5e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 		 331 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.35 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.27 
 
 		 331 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.319247  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.86 
 
 		 324 aa  352  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0043  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 		 321 aa  352  4e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.270111  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.48 
 
 		 315 aa  352  7e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.03 
 
 		 309 aa  352  7e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.48 
 
 		 315 aa  352  7e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.05 
 
 		 311 aa  351  8e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.6 
 
 		 316 aa  351  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.03 
 
 		 309 aa  351  8.999999999999999e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.6 
 
 		 316 aa  351  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.63 
 
 		 331 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.147095  normal  0.740679 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0670  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.57 
 
 		 331 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00572245  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15031  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.57 
 
 		 331 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 		 324 aa  351  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 		 316 aa  349  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 		 331 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>