More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_15031 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0670  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
331 aa  682    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00572245  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15031  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
331 aa  682    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  88.52 
 
 
331 aa  607  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.147095  normal  0.740679 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  85.2 
 
 
331 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.69 
 
 
331 aa  581  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.08 
 
 
331 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  82.78 
 
 
337 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  82.78 
 
 
331 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.08 
 
 
331 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.319247  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  80.66 
 
 
331 aa  558  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.2 
 
 
331 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.14 
 
 
338 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.75 
 
 
338 aa  492  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.34 
 
 
330 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.7 
 
 
318 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.7 
 
 
318 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.43 
 
 
330 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.84 
 
 
330 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.57 
 
 
316 aa  350  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.87 
 
 
322 aa  349  4e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.63 
 
 
322 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.73 
 
 
318 aa  346  4e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
313 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  52.09 
 
 
317 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.56 
 
 
315 aa  342  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  52.76 
 
 
326 aa  340  1e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.72 
 
 
317 aa  339  4e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  54.17 
 
 
312 aa  335  9e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.09 
 
 
359 aa  334  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.9 
 
 
309 aa  332  7.000000000000001e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.38 
 
 
315 aa  331  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.58 
 
 
313 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.56 
 
 
315 aa  331  1e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
316 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.61 
 
 
325 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.1 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.1 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.1 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.1 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.1 
 
 
317 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.1 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.1 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.1 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.1 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.1 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.62 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.27 
 
 
309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
314 aa  326  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
312 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.6 
 
 
315 aa  326  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1451  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.13 
 
 
315 aa  325  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.79 
 
 
317 aa  325  6e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1558  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.94 
 
 
312 aa  325  7e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.23 
 
 
319 aa  325  7e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.08 
 
 
318 aa  325  8.000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.45 
 
 
315 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
316 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.92 
 
 
319 aa  322  5e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
332 aa  322  6e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.96 
 
 
314 aa  322  8e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3837  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.6 
 
 
315 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.6 
 
 
315 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0797  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97766  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.6 
 
 
315 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.6 
 
 
315 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.8 
 
 
314 aa  321  9.000000000000001e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.25 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3173  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283101  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0793  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000256168  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0765  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
309 aa  320  3e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  50.64 
 
 
313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
311 aa  319  3.9999999999999996e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.45 
 
 
314 aa  319  5e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  318  6e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.96 
 
 
315 aa  318  9e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.28 
 
 
315 aa  318  9e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.13 
 
 
311 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
315 aa  317  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
315 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  52.1 
 
 
321 aa  317  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.13 
 
 
314 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  51.29 
 
 
327 aa  317  2e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.48 
 
 
314 aa  316  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
316 aa  316  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 
315 aa  316  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
325 aa  316  4e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 
315 aa  316  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
320 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
316 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
320 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
320 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 
315 aa  315  5e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.43 
 
 
311 aa  315  5e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 
315 aa  315  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>