More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4501 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
317 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.99 
 
 
314 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 
314 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.38 
 
 
316 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.26 
 
 
321 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.06 
 
 
316 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.18 
 
 
321 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.81 
 
 
316 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.3 
 
 
321 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.3 
 
 
321 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.78 
 
 
314 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  60.7 
 
 
312 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.28 
 
 
316 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.14 
 
 
313 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.55 
 
 
317 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.47 
 
 
315 aa  371  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.47 
 
 
315 aa  371  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  58.01 
 
 
317 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.64 
 
 
316 aa  371  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.18 
 
 
325 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.33 
 
 
322 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 
314 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
309 aa  364  1e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.14 
 
 
311 aa  363  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.01 
 
 
318 aa  362  4e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.46 
 
 
319 aa  362  6e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  361  8e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  361  8e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  361  8e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  361  8e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  361  8e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
314 aa  361  8e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  361  8e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.05 
 
 
315 aa  361  8e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  361  8e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  361  8e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
317 aa  361  8e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
317 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
320 aa  360  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.69 
 
 
319 aa  360  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
317 aa  359  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.83 
 
 
319 aa  359  4e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2817  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
317 aa  359  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00466763  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 
309 aa  358  5e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 
309 aa  358  6e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.27 
 
 
359 aa  358  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.05 
 
 
315 aa  358  9e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 
309 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.5 
 
 
322 aa  356  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  56.27 
 
 
321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
320 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
318 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.77 
 
 
315 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
315 aa  355  5.999999999999999e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
318 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
318 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
318 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
318 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
318 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
318 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
318 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
318 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
320 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
320 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.56 
 
 
316 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.87 
 
 
316 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.87 
 
 
316 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 
311 aa  352  5e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.92 
 
 
315 aa  352  5e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.37 
 
 
319 aa  352  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.22 
 
 
318 aa  351  8e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.27 
 
 
318 aa  350  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
317 aa  350  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53 
 
 
316 aa  350  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.09 
 
 
325 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
311 aa  350  3e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
312 aa  349  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  55.45 
 
 
319 aa  349  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0971  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.79 
 
 
311 aa  349  4e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.37 
 
 
315 aa  349  4e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
324 aa  349  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
316 aa  349  4e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.05 
 
 
321 aa  348  7e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.77 
 
 
321 aa  348  8e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  55.77 
 
 
321 aa  348  8e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
327 aa  348  8e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.95 
 
 
318 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 
323 aa  347  1e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.01 
 
 
327 aa  346  2e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.67 
 
 
313 aa  346  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 
323 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  53.67 
 
 
313 aa  347  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.29 
 
 
309 aa  346  2e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.88 
 
 
314 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
315 aa  346  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.09 
 
 
310 aa  346  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>