More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1163 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
315 aa  639    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  98.41 
 
 
315 aa  630  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.95 
 
 
315 aa  491  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.38 
 
 
316 aa  471  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1453  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.88 
 
 
316 aa  435  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.42 
 
 
317 aa  378  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.06 
 
 
316 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.87 
 
 
325 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.45 
 
 
313 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.05 
 
 
314 aa  368  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 
316 aa  364  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.83 
 
 
315 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.69 
 
 
314 aa  359  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.33 
 
 
318 aa  358  6e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.86 
 
 
314 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.78 
 
 
317 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.86 
 
 
314 aa  355  5e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.14 
 
 
315 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.41 
 
 
316 aa  354  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  56.91 
 
 
317 aa  354  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.19 
 
 
315 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  56.01 
 
 
327 aa  353  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.78 
 
 
316 aa  352  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
317 aa  351  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
317 aa  351  8e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
317 aa  351  8e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
317 aa  351  8e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
317 aa  351  8e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
317 aa  351  8e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
317 aa  351  8e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
317 aa  351  8e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
317 aa  351  8e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
317 aa  350  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.91 
 
 
319 aa  350  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.46 
 
 
316 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.91 
 
 
322 aa  350  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.51 
 
 
314 aa  349  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.24 
 
 
329 aa  348  6e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.47 
 
 
319 aa  348  6e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0522  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.87 
 
 
321 aa  347  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00402651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0535  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.87 
 
 
321 aa  347  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0143488  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0138  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
321 aa  346  3e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.056526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
322 aa  343  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
315 aa  343  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
319 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.87 
 
 
314 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.03 
 
 
330 aa  340  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.7 
 
 
309 aa  340  2e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.56 
 
 
314 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.56 
 
 
346 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.17 
 
 
325 aa  336  1.9999999999999998e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
317 aa  335  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.14 
 
 
330 aa  335  5e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
309 aa  333  2e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.83 
 
 
318 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.83 
 
 
318 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.19 
 
 
309 aa  333  3e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  53.31 
 
 
326 aa  333  3e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
329 aa  332  5e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
309 aa  332  6e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.41 
 
 
318 aa  332  6e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.27 
 
 
323 aa  331  8e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.27 
 
 
314 aa  331  9e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.33 
 
 
330 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
321 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.41 
 
 
310 aa  330  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.41 
 
 
310 aa  330  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
328 aa  329  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.82 
 
 
325 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 
327 aa  329  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.37 
 
 
312 aa  329  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.6 
 
 
314 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
310 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  53.48 
 
 
321 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.16 
 
 
338 aa  329  5.0000000000000004e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
321 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
311 aa  328  8e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.63 
 
 
316 aa  328  8e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
321 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.59 
 
 
316 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.09 
 
 
338 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
310 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.56 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
331 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0839  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.05 
 
 
317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.63 
 
 
310 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.02 
 
 
316 aa  326  3e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.98 
 
 
310 aa  326  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53 
 
 
315 aa  326  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53 
 
 
315 aa  326  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0645  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.05 
 
 
310 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.33 
 
 
314 aa  325  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
359 aa  325  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.38 
 
 
310 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.2 
 
 
316 aa  325  8.000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0971  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
311 aa  325  9e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3173  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 
315 aa  325  9e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283101  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0793  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 
315 aa  325  9e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000256168  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0765  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 
315 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>