More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3092 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
319 aa  642    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2630  ribose-phosphate pyrophosphokinase  81.45 
 
 
320 aa  508  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.75 
 
 
325 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.03 
 
 
319 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.4 
 
 
319 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.04 
 
 
316 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.09 
 
 
315 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.42 
 
 
313 aa  418  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.34 
 
 
315 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.19 
 
 
317 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.19 
 
 
317 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.19 
 
 
317 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.19 
 
 
317 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.19 
 
 
317 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.19 
 
 
317 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.19 
 
 
317 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.19 
 
 
317 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.19 
 
 
317 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.19 
 
 
317 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.87 
 
 
317 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.29 
 
 
315 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.15 
 
 
316 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.34 
 
 
322 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.23 
 
 
314 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.19 
 
 
329 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.09 
 
 
318 aa  395  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  60.25 
 
 
327 aa  395  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.92 
 
 
322 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  59.94 
 
 
317 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.06 
 
 
324 aa  393  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.77 
 
 
317 aa  387  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.59 
 
 
314 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.35 
 
 
314 aa  374  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.69 
 
 
314 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.49 
 
 
327 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.74 
 
 
314 aa  368  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0018  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.58 
 
 
322 aa  364  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00325732  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.91 
 
 
329 aa  364  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  59.16 
 
 
312 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0043  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.15 
 
 
321 aa  365  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.270111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 
316 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.05 
 
 
323 aa  364  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.88 
 
 
324 aa  363  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.32 
 
 
319 aa  364  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0138  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.35 
 
 
321 aa  363  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.056526  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 
325 aa  363  2e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 
359 aa  362  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
321 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0522  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.35 
 
 
321 aa  360  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00402651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0535  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.35 
 
 
321 aa  360  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0143488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
321 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.06 
 
 
321 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
321 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.47 
 
 
325 aa  358  8e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.64 
 
 
320 aa  358  8e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 
316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.18 
 
 
316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.74 
 
 
314 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  54.81 
 
 
326 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.39 
 
 
320 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 
316 aa  355  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  57.23 
 
 
321 aa  355  5e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.62 
 
 
324 aa  355  5.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  55.77 
 
 
313 aa  355  7.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.07 
 
 
320 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.29 
 
 
324 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.28 
 
 
317 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0289  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.92 
 
 
317 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
318 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.07 
 
 
320 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
318 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
318 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3730  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 
316 aa  353  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.322716 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
318 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.39 
 
 
320 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
318 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.41 
 
 
316 aa  353  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
318 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.87 
 
 
318 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
318 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
318 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
318 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
338 aa  353  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.87 
 
 
318 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.38 
 
 
315 aa  352  4e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.35 
 
 
316 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.9 
 
 
320 aa  351  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.69 
 
 
317 aa  351  7e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
318 aa  351  8e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  55.94 
 
 
319 aa  351  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.6 
 
 
316 aa  351  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.6 
 
 
316 aa  351  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
330 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  56.25 
 
 
321 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.25 
 
 
321 aa  351  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.83 
 
 
327 aa  351  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.91 
 
 
315 aa  350  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.16 
 
 
330 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.12 
 
 
310 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>