More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1674 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
327 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  89.91 
 
 
327 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  89.78 
 
 
323 aa  598  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  87.93 
 
 
323 aa  585  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  86.69 
 
 
323 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  87.42 
 
 
317 aa  560  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.75 
 
 
331 aa  542  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.31 
 
 
316 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.84 
 
 
316 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.69 
 
 
325 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 
316 aa  363  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.09 
 
 
316 aa  355  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 
313 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.54 
 
 
309 aa  354  1e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
316 aa  352  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.61 
 
 
322 aa  349  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.33 
 
 
319 aa  347  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.77 
 
 
321 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  54.19 
 
 
313 aa  347  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 
314 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.05 
 
 
319 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.03 
 
 
311 aa  346  2e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.37 
 
 
309 aa  347  2e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.23 
 
 
309 aa  347  2e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.77 
 
 
321 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.77 
 
 
321 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.54 
 
 
309 aa  345  7e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.7 
 
 
309 aa  345  7e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.7 
 
 
314 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.21 
 
 
309 aa  344  1e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  57.14 
 
 
327 aa  344  1e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.21 
 
 
309 aa  343  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
321 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.73 
 
 
319 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.88 
 
 
309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
318 aa  342  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
318 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
316 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.56 
 
 
308 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.32 
 
 
325 aa  339  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
314 aa  339  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.87 
 
 
320 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.87 
 
 
320 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.87 
 
 
320 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.1 
 
 
315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.09 
 
 
314 aa  338  8e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
315 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
315 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.21 
 
 
323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.22 
 
 
311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.99 
 
 
315 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
320 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
318 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.57 
 
 
313 aa  335  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
318 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
318 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
318 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
318 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
318 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
318 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
318 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2630  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 
320 aa  334  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
313 aa  334  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
318 aa  334  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1471  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
309 aa  334  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.623247 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  54.69 
 
 
312 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
320 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.69 
 
 
317 aa  333  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
310 aa  332  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
310 aa  332  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.76 
 
 
324 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.57 
 
 
359 aa  332  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.9 
 
 
313 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.9 
 
 
313 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  331  9e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.94 
 
 
316 aa  331  9e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
317 aa  331  9e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.9 
 
 
313 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
317 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.26 
 
 
318 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2923  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.38 
 
 
313 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.9 
 
 
310 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.94 
 
 
316 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.9 
 
 
310 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.9 
 
 
310 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.68 
 
 
314 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.21 
 
 
311 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
315 aa  329  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
317 aa  329  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>