More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2768 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 		 316 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  99.68 
 
 		 316 aa  640    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  87.66 
 
 		 316 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.86 
 
 		 314 aa  541  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  85.17 
 
 		 314 aa  540  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  80.06 
 
 		 314 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  82.28 
 
 		 314 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  70.38 
 
 		 312 aa  455  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.77 
 
 		 321 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.52 
 
 		 321 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.52 
 
 		 321 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2817  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.65 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00466763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.52 
 
 		 321 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.61 
 
 		 315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0673  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.54 
 
 		 314 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000671501  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0839  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.51 
 
 		 317 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.14 
 
 		 313 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.08 
 
 		 312 aa  391  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1558  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.08 
 
 		 312 aa  388  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.81 
 
 		 316 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.77 
 
 		 317 aa  388  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.29 
 
 		 315 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.38 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000191393  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.29 
 
 		 315 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  60.97 
 
 		 321 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.32 
 
 		 319 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.32 
 
 		 320 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.18 
 
 		 313 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.01 
 
 		 319 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.36 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.73 
 
 		 316 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.06 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.51 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.05 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.46 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.29 
 
 		 312 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.49 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  59.03 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.49 
 
 		 324 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.96 
 
 		 313 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.49 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.68 
 
 		 323 aa  374  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.97 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.47 
 
 		 315 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1451  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.81 
 
 		 315 aa  371  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212954  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0607  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 		 315 aa  371  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.1 
 
 		 323 aa  372  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.16 
 
 		 324 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  59.49 
 
 		 321 aa  371  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.71 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.13 
 
 		 310 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.54 
 
 		 316 aa  371  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.11 
 
 		 319 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.49 
 
 		 321 aa  371  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 		 311 aa  368  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.39 
 
 		 318 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.71 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0588  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.05 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  59.16 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.71 
 
 		 318 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.71 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.65 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.71 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.71 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.22 
 
 		 322 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.06 
 
 		 318 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.71 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.73 
 
 		 327 aa  368  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.71 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.71 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.91 
 
 		 310 aa  364  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 320 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.26 
 
 		 318 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697734  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.19 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.88 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 		 314 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3730  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.78 
 
 		 316 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.322716 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.74 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.1 
 
 		 323 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 		 311 aa  365  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 320 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.74 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 320 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 320 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 		 324 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 		 327 aa  363  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.59 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.59 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.59 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.73 
 
 		 331 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.87 
 
 		 313 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.56 
 
 		 316 aa  362  3e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0283  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.41 
 
 		 318 aa  362  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 		 310 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>