More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0839 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0839  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
317 aa  644    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.04 
 
 
312 aa  484  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.76 
 
 
313 aa  481  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0673  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.52 
 
 
314 aa  478  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000671501  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1558  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.44 
 
 
312 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1451  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.15 
 
 
315 aa  463  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.97 
 
 
314 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60 
 
 
314 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.9 
 
 
316 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 
314 aa  394  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.83 
 
 
316 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2817  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.22 
 
 
317 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00466763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.51 
 
 
316 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.32 
 
 
317 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.81 
 
 
321 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  58.39 
 
 
312 aa  371  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.04 
 
 
321 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.68 
 
 
321 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.68 
 
 
321 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.01 
 
 
314 aa  368  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.41 
 
 
317 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.14 
 
 
315 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
359 aa  362  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.29 
 
 
316 aa  359  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.7 
 
 
325 aa  358  5e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.01 
 
 
316 aa  358  7e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.6 
 
 
318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.56 
 
 
322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.63 
 
 
311 aa  352  5e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
319 aa  351  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.94 
 
 
314 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
315 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
315 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.59 
 
 
313 aa  349  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
314 aa  349  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0283  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.89 
 
 
318 aa  349  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 
323 aa  348  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.98 
 
 
313 aa  347  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.57 
 
 
324 aa  346  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.66 
 
 
312 aa  345  5e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.72 
 
 
318 aa  345  8e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
324 aa  344  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 
318 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.65 
 
 
324 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.31 
 
 
312 aa  343  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.48 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  55.02 
 
 
321 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.06 
 
 
309 aa  343  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.14 
 
 
315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.31 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 
318 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 
318 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.9 
 
 
318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 
318 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 
318 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 
318 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 
318 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 
318 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.9 
 
 
318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.14 
 
 
316 aa  342  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 
318 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.66 
 
 
311 aa  341  8e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.31 
 
 
321 aa  341  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 
318 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  54.31 
 
 
321 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.16 
 
 
316 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  53.31 
 
 
319 aa  340  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.95 
 
 
316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.19 
 
 
327 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.55 
 
 
320 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0607  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
315 aa  339  4e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.7 
 
 
316 aa  339  4e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  54.49 
 
 
313 aa  338  5e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.58 
 
 
309 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0588  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
315 aa  338  9e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
320 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
320 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
320 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.48 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  51.59 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.83 
 
 
320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.63 
 
 
318 aa  335  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.82 
 
 
336 aa  335  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.83 
 
 
320 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.22 
 
 
309 aa  335  5e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.63 
 
 
338 aa  335  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.72 
 
 
320 aa  335  7e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 
330 aa  334  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.63 
 
 
330 aa  335  9e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.43 
 
 
322 aa  334  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.45 
 
 
338 aa  333  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.02 
 
 
315 aa  333  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.53 
 
 
315 aa  332  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2105  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.24 
 
 
318 aa  333  3e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537624  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3837  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.7 
 
 
315 aa  332  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
313 aa  332  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>